R 两列的完整案例求和

Question

如何对两列的完整案例数求和？

和 c 等于：

      a  b
[1,] NA NA
[2,]  1  1
[3,]  1  1
[4,] NA  1

应用类似的东西

rollapply(c, 2, function(x) sum(complete.cases(x)),fill=NA)

我想取回一个号码 2 在这种情况下。这将用于包含许多列的大型数据集，所以我想使用 rollapply 跨越整个集合而不是简单地做 sum(complete.cases(a,b)).

是我想多了吗？

谢谢！

Answer 1

您可以使用如下所示的rollapply计算相邻矩阵列中的完整案例的数量：

m <- matrix(c(NA,1,1,NA,1,1,1,1),ncol=4)
#     [,1] [,2] [,3] [,4]
#[1,]   NA    1    1    1
#[2,]    1   NA    1    1

library(zoo)

rowSums(rollapply(is.na(t(m)), 2, function(x) !any(x)))
#[1] 0 1 2

.

Answer 2

你试过了吗 sum(complete.cases(x))?!

set.seed(123)
x <- matrix( sample( c(NA,1:5) , 15 , TRUE ) , 5 )
#     [,1] [,2] [,3]
#[1,]    1   NA    5
#[2,]    4    3    2
#[3,]    2    5    4
#[4,]    5    3    3
#[5,]    5    2   NA


sum(complete.cases(x))
#[1] 3

为了找到 complete.cases() 前两列：

sum(complete.cases(x[,1:2]))
#[1] 4

并 apply 到 a 的两列 matrix 在整个矩阵中，你可以这样做：

#  Bigger data for example
set.seed(123)
x <- matrix( sample( c(NA,1:5) , 50 , TRUE ) , 5 )
#     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7] [,8] [,9] [,10]
#[1,]    1   NA    5    5    5    4    5    2   NA    NA
#[2,]    4    3    2    1    4    3    5    4    2     1
#[3,]    2    5    4   NA    3    3    4    1    2     2
#[4,]    5    3    3    1    5    1    4    1    2     1
#[5,]    5    2   NA    5    3   NA   NA    1   NA     5

# Column indices
id <- seq( 1 , ncol(x) , by = 2 )
[1] 1 3 5 7 9
apply( cbind(id,id+1) , 1 , function(i) sum(complete.cases(x[,c(i)])) )
[1] 4 3 4 4 3

complete.cases() 在整个过程中按行工作 data.frame 或者 matrix 返回 TRUE 对于那些没有丢失任何数据的行。撇开小事不谈， "c" 是一个错误的变量名，因为 c() 是最常用的功能之一。

Answer 3

这应该适用于两者 matrix 和 data.frame

> sum(apply(c, 1, function(x)all(!is.na(x))))

[1] 2

你可以简单地迭代大矩阵 M

for (i in 1:(ncol(M)-1) ){
    c <- M[,c(i,i+1]
    agreement <- sum(apply(c, 1, function(x)all(!is.na(x))))
}