是否有用于对GPU进行排序的字符串数组的算法？

Question

数组排序有大约一百万个字符串，其中每个字符串都可以长到一百万个字符。

我正在寻找任何用于GPU分类算法的实现。

我有一个大小约为1MB的数据块，我需要构造后缀数组。现在，您可以看到如何在真正少量的内存中拥有一百万个字符串。

Answer 1

GPU排序中的技术状态并不特别令人鼓舞。

从2009年排序32位整数以下论文（有2名是NVIDIA的研究人员）只有4.与4核心约克菲尔德的最佳CPU排序相比，GTX280的最佳CUDA排序增加23％。

http://www.marland.org/files/papers/gpusort -ipdps09.pdf

这在GPU上使用了基数，并在CPU上合并排序。你需要一个基于比较的排序来构建后缀数组，所以而不是GPU Radix排序，其中纸张中最好的是GPU合并排序，这实现了GPU Radix Sort的速度大约一半（100万键） - 即比CPU合并排序慢的约40％。

添加变量长度键似乎可能导致扭曲中的线程将在GPU上脱离同步，因此可以减少GPU的性能超过CPU。

总的来说，如果您的目的是构建一个有效的系统，我建议您使用CPU实现此问题，因为它会更快更容易写入。

但是，如果您的目的是实验或只是为了了解GPU，那么您可以在CUDA SDK中找到从纸张中的合并分类的CUDA实现：

http：//developer.dowload.nvidia .com / compute / cuda / sdk /网站/ data-parallel_algorithms.html