是否有适用于Torque/PBS的Drmaa Java库？

Question

有人知道已知可以使用PBS/扭矩群集软件的DRMAA-API实现Java吗？

背后的背景是：我想使用符合DRMAA的API将作业提交给Java的新设置Linux群集。集群由 PBS/扭矩. 。扭矩包括PBS DRMAA 1.0库，用于包含DRMA-C结合的扭矩/PB，并在libdrmaa.so和.a二进制中提供。我知道Sun Grid Engine包括Drmaa.jar提供Java-Drmaa API。实际上，我选择使用SGE，但决定先尝试PBS。

该决定背后的理论是：
“ Drmaa是标准，因此Java API只需要符合标准的DRMAA-C结合。”但是，我找不到这样的“ drmaa-c-java api”，现在假设此假设是错误的，并且Java库是特定于引擎的。

编辑：我刚刚尝试了Sun Grid Engine包装中的Drmaa.jar，并试图与PBS Libdrmaa.so交叉使用。毫不奇怪，失败（JNI不满足的链接错误）。

结论：它不起作用！搜索后，我只看到以下几个选项：

1. 安装Globus工具包的网格道。 Gridway已安装了PBS的Ontop，声称可以在Java提供Drmaa。对于我的设置来说，看起来太复杂了。
2. 从Java调用System Command QSUB，QSTAT等来提交DRMAA，提交给PBS。简单，但不太好。

3. 我自己实施drmaa约束。太复杂了...

4. 切换到网格引擎。在我看来，对于语言绑定，GE优于PB。

我倾向于选择选项2。或4.有任何建议？

Answer 1

经过更多的搜索，看起来我必须自己写东西。似乎还没有最佳的答案，但是对于那些尝试这样的人来说，它可以作为警告。

提出这些问题的最佳场所可能是扭矩邮件列表：www.clusterresources.com/resources/mailing-lists.php

首先，您不能仅使用任何DRMAA-JAVA库并将其与任何DRMAA-C实现一起使用的原因是：DRMAA描述资源控件的接口，而不是如何实现。供应商可以使用DRMAA-C实施并仅使用这些功能，但不必这样做。它可以使用引擎中的任何东西。因此，一个重要的消息是：如果您需要某些语言绑定，请确保它们在所需的所有语言中都存在。

关于提到的选项：

1. 使用网格/Globus工具包： http://www.gridway.org/doku.php?id=start优势：Gridway是一个支持许多资源管理系统（SGE，PBS，...）的元调度程序。可能，目前获得DRMAA界面与PBS一起使用的唯一方法。缺点：这似乎是层和复杂性的通胀。没有这个经验。

2. 使用系统命令，QSUB，QSTAT，QDEL。优势：快速黑客缺点：肮脏的黑客，需要实现输出的解析器，可能不会注意到是否出现问题，请传递来自stdin/stdout/stderr的消息，而不是便携式

3. 使用JNI应该有可能为DRMAA.C优势中的每个C函数创建一个绑定：将提供完整的DRMAA实现（希望）缺点：涉及编译的代码，大量的手动包装C函数（也许可以自动化这一点）

4. 切换到另一个网格引擎。可能，我们应该以前做过此分析。但是，我们已经有了其他扭矩群，并且有经验。操作两个将创建更多的异质基础架构。

5. 从其他供应商更改现有的DRMAA库。不知道这是否可行...我们也会研究。

Answer 2

我也有这个问题。这是一个针对PBS/扭矩创建面向对象的C ++和Java Drmaa绑定的项目。

不利的一面是您必须能够加载从C ++代码创建的库，因此它不是只能作为.jar文件分发的“纯Java”实现，希望最终用户提供libdrmaa.ose。 “ 他们自己。

对于它的价值，这里是：https://github.com/bryan-lunt/pbsjavadrmaa/

Answer 3

您是否曾经决定该怎么办？您是否设法使Java Drmaa绑定使用扭矩/PBS？我希望获得一些在扭矩/PBS系统上工作的Java Drmaa代码，如果您已经完成了艰苦的工作，我很想偷它。

但是，如果没有，那么制作一些Java绑定还不错，如果没有其他人这样做，我会做的。几年前，我成功地修改了SGE的Drmaa Java绑定，以与Xgrid的新DRMAA实施合作（现在是Stale，但也许很快要复活）。

我什至写了一篇简短的博客文章（包括指向一般说明的链接）：

http://edbaskerville.com/2006/07/11/java-bindings-working/