Système de coordonnées de référence de Raster & Polygones en R

Question

J'ai plusieurs polygones et j'aime extraire des valeurs moyennes de plusieurs couches de trame au sein de ces polygones. Quand j'ai ajouté à ceux ArcMap j'ai réalisé que les projections des deux types de données ne correspondent pas. Je pouvais résoudre le problème de l'affichage dans ArcGIS en utilisant l'outil de projet (boîte à outils de gestion des données> Projections et transformations jeu d'outils> raster). J'ai donc essayé de normaliser la projection en chargeant les données dans R de la manière suivante (une partie du code):

Rasters:

for (i in 1:length(rasterlist1))
{ndvi_raster_stack1[i]<-raster(rasterlist1[i])
raster::NAvalue(ndvi_raster_stack1[[i]])<--999
projection(ndvi_raster_stack1[[i]])<-"+proj=utm +ellps=WGS84 +datum=WGS84 +units=m"}

> ndvi_raster_stack1[[1]] 
class       : RasterLayer  
dimensions  : 226, 150, 33900  (nrow, ncol, ncell) 
resolution  : 0.57504, 0.5753628  (x, y) 
extent      : -28.728, 57.528, -55.08, 74.952  (xmin, xmax, ymin, ymax) 
coord. ref. : +proj=utm +ellps=WGS84 +datum=WGS84 +units=m +towgs84=0,0,0  
values      : Z:\master\lusmeg_sw_kernel_data\ndvi0910\Y2008_P47.tif  
min value   : -91  
max value   : 550.8125

Polygones:

for (i in 1:length(poplist))
{pop_kernels[i]<-readShapeSpatial(poplist[i],repair=TRUE,proj4string=CRS("+proj=utm +ellps=WGS84 +datum=WGS84 +units=m"))
pop_kernels[[i]]<-unionSpatialPolygons(pop_kernels[[i]],ID=c(rep(1,times=length(pop_kernels[[i]])-1),0),threshold=NULL,avoidGEOS=FALSE)}

> str(pop_kernels[[1]])
    Formal class 'SpatialPolygons' [package "sp"] with 4 slots
      ..@ polygons   :List of 2
      .. ..$ :Formal class 'Polygons' [package "sp"] with 5 slots
      .. .. .. ..@ Polygons :List of 2
      .. .. .. .. ..$ :Formal class 'Polygon' [package "sp"] with 5 slots
      .. .. .. .. .. .. ..@ labpt  : num [1:2] 2404422 893343
      .. .. .. .. .. .. ..@ area   : num 1.15e+12
      .. .. .. .. .. .. ..@ hole   : logi FALSE
      .. .. .. .. .. .. ..@ ringDir: int 1
      .. .. .. .. .. .. ..@ coords : num [1:1625, 1:2] 2551236 2533236 2533236 2523236 2523236 ...
      .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "dimnames")=List of 2
      .. .. .. .. .. .. .. .. ..$ : NULL
      .. .. .. .. .. .. .. .. ..$ : chr [1:2] "x" "y"
      .. .. .. .. ..$ :Formal class 'Polygon' [package "sp"] with 5 slots
      .. .. .. .. .. .. ..@ labpt  : num [1:2] 2468549 865776
      .. .. .. .. .. .. ..@ area   : num 6.31e+11
      .. .. .. .. .. .. ..@ hole   : logi TRUE
      .. .. .. .. .. .. ..@ ringDir: int -1
      .. .. .. .. .. .. ..@ coords : num [1:1385, 1:2] 2551236 2551236 2563236 2563236 2569236 ...
      .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "dimnames")=List of 2
      .. .. .. .. .. .. .. .. ..$ : NULL
      .. .. .. .. .. .. .. .. ..$ : chr [1:2] "x" "y"
      .. .. .. ..@ plotOrder: int [1:2] 1 2
      .. .. .. ..@ labpt    : num [1:2] 2404422 893343
      .. .. .. ..@ ID       : chr "0"
      .. .. .. ..@ area     : num 1.15e+12
      .. ..$ :Formal class 'Polygons' [package "sp"] with 5 slots
      .. .. .. ..@ Polygons :List of 1
      .. .. .. .. ..$ :Formal class 'Polygon' [package "sp"] with 5 slots
      .. .. .. .. .. .. ..@ labpt  : num [1:2] 2468549 865776
      .. .. .. .. .. .. ..@ area   : num 6.31e+11
      .. .. .. .. .. .. ..@ hole   : logi FALSE
      .. .. .. .. .. .. ..@ ringDir: int 1
      .. .. .. .. .. .. ..@ coords : num [1:1385, 1:2] 2551236 2541236 2541236 2529236 2529236 ...
      .. .. .. .. .. .. .. ..- attr(*, "dimnames")=List of 2
      .. .. .. .. .. .. .. .. ..$ : NULL
      .. .. .. .. .. .. .. .. ..$ : chr [1:2] "x" "y"
      .. .. .. ..@ plotOrder: int 1
      .. .. .. ..@ labpt    : num [1:2] 2468549 865776
      .. .. .. ..@ ID       : chr "1"
      .. .. .. ..@ area     : num 6.31e+11
      ..@ plotOrder  : int [1:2] 1 2
      ..@ bbox       : num [1:2, 1:2] 1819236 207017 3013236 1577017
      .. ..- attr(*, "dimnames")=List of 2
      .. .. ..$ : chr [1:2] "x" "y"
      .. .. ..$ : chr [1:2] "min" "max"
      ..@ proj4string:Formal class 'CRS' [package "sp"] with 1 slots
      .. .. ..@ projargs: chr " +proj=utm +ellps=WGS84 +datum=WGS84 +units=m +towgs84=0,0,0"

Je peux tracer les polygones et les rasters séparement, mais lorsque je tente de tracer un des polygones sur une trame, les polygones ne sont pas affichés:

plot(ndvi_raster_stack1[[1]],xlab="Longitude",ylab="Latitude")
plot(pop_kernels[[1]],col="black",add=TRUE)

Il semble qu'ils ne toujours pas « chevauchement ». Ceci est également indiqué par les différentes boîtes englobantes, je pense:

> bbox(ndvi_raster_stack1[[1]])
       min    max
s1 -28.728 57.528
s2 -55.080 74.952

> bbox(pop_kernels[[1]])
      min     max
x 1819236 3013236
y  207017 1577017

Parce que je veux extraire les valeurs de trame dans les polygones, je dois être sûr qu'ils sont référencés de manière correcte. Est-ce que quelqu'un a une idée de ce que pourrait être le problème?

Answer 1

Votre shapefile polygone a un système de coordonnées de latitude isnt long - les chiffres sont très grandes et probablement mètres dans un système. L'attribution d'un proj4string ne reprojeter les données à lat long, il définit simplement l'étiquette de ce que les coordonnées qu'il pense. Dans ce cas, son tort!

Vous devez vous assurer que vos polygones obtenir le droit proj4string pour les numéros qu'ils ont en eux - il peut y avoir un [shapefile] fichier .prj avec le .shp et .dbf qui vous dit. Réglez le proj4string à cela.

Ensuite, vous pouvez utiliser spTransform de sp ou rgdal pour projeter vos polygones aux coordonnées WGS84 lat-long.

Il est toujours préférable de transformer les polygones en coordonnées raster, puisque les coordonnées de jouer avec raster peut signifier reprojeter toute la grille, ce qui est en désordre ...