R 2 つの列の完全なケースを合計する

Question

2 つの列の完全なケースの数を合計するにはどうすればよいですか?

と c に等しい：

      a  b
[1,] NA NA
[2,]  1  1
[3,]  1  1
[4,] NA  1

のようなものを適用すると、

rollapply(c, 2, function(x) sum(complete.cases(x)),fill=NA)

単一の番号を返したいのですが、 2 この場合。これは多くの列を持つ大規模なデータセット用なので、使用したいと思います rollapply 単に実行するのではなく、セット全体にわたって sum(complete.cases(a,b)).

考えすぎでしょうか？

ありがとう！

Answer 1

rollapplyを使用して、隣接するマトリックス列の完全なケース数をこのように計算できます。

m <- matrix(c(NA,1,1,NA,1,1,1,1),ncol=4)
#     [,1] [,2] [,3] [,4]
#[1,]   NA    1    1    1
#[2,]    1   NA    1    1

library(zoo)

rowSums(rollapply(is.na(t(m)), 2, function(x) !any(x)))
#[1] 0 1 2

.

Answer 2

試しましたか sum(complete.cases(x))?!

set.seed(123)
x <- matrix( sample( c(NA,1:5) , 15 , TRUE ) , 5 )
#     [,1] [,2] [,3]
#[1,]    1   NA    5
#[2,]    4    3    2
#[3,]    2    5    4
#[4,]    5    3    3
#[5,]    5    2   NA


sum(complete.cases(x))
#[1] 3

を見つけるには、 complete.cases() 最初の 2 つの列のうち:

sum(complete.cases(x[,1:2]))
#[1] 4

そして、へ apply の 2 列に matrix マトリックス全体でこれを行うことができます。

#  Bigger data for example
set.seed(123)
x <- matrix( sample( c(NA,1:5) , 50 , TRUE ) , 5 )
#     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6] [,7] [,8] [,9] [,10]
#[1,]    1   NA    5    5    5    4    5    2   NA    NA
#[2,]    4    3    2    1    4    3    5    4    2     1
#[3,]    2    5    4   NA    3    3    4    1    2     2
#[4,]    5    3    3    1    5    1    4    1    2     1
#[5,]    5    2   NA    5    3   NA   NA    1   NA     5

# Column indices
id <- seq( 1 , ncol(x) , by = 2 )
[1] 1 3 5 7 9
apply( cbind(id,id+1) , 1 , function(i) sum(complete.cases(x[,c(i)])) )
[1] 4 3 4 4 3

complete.cases() 全体にわたって行単位で動作します data.frame または matrix 戻る TRUE データが欠落していない行の場合。マイナーな話はさておき、 "c" は不適切な変数名です。 c() は最もよく使用される関数の 1 つです。

Answer 3

matrixとdata.frame

の両方のためのこのShoudl作品

> sum(apply(c, 1, function(x)all(!is.na(x))))

[1] 2

.

、あなたは単に大きな行列M

を繰り返すことができます。

for (i in 1:(ncol(M)-1) ){
    c <- M[,c(i,i+1]
    agreement <- sum(apply(c, 1, function(x)all(!is.na(x))))
}

.