PETSCのインストールがMacportで失敗しました。
-
29-09-2019 - |
質問
インストールしようとしています PETSC MacPortsで。私の最後の目標は、インストールすることです libmesh 私のMacで。 PETSCをインストールしようとしているときは、構成中に失敗します。 Libmeshをインストールしようとする前に、PETSCをインストールする必要があります。
これがログのエラー部分です。
:info:configure TESTING: checkFortranLibraries from config.compilers(/opt/local/var/macports/build/_opt_local_var_macports_sources_rsync.macports.org_release_ports_math_petsc/work/petsc-3.1-p4/config/BuildSystem/config/compilers.py:624)
:info:configure *******************************************************************************
:info:configure UNABLE to EXECUTE BINARIES for config/configure.py
:info:configure -------------------------------------------------------------------------------
:info:configure Cannot run executables created with C. If this machine uses a batch system
:info:configure to submit jobs you will need to configure using/configure.py with the additional option --with-batch.
:info:configure Otherwise there is problem with the compilers. Can you compile and run code with your C/C++ (and maybe Fortran) compilers?
:info:configure *******************************************************************************
:info:configure
:info:configure shell command " cd "/opt/local/var/macports/build/_opt_local_var_macports_sources_rsync.macports.org_release_ports_math_petsc/work/petsc-3.1-p4" && /opt/local/var/macports/build/_opt_local_var_macports_sources_rsync.macports.org_release_ports_math_petsc/work/petsc-3.1-p4/config/configure.py --prefix=/opt/local --with-python --with-c-support=1 --with-c++-support=1 --with-pic=fPIC --with-shared=1 --prefix=/opt/local/var/macports/build/_opt_local_var_macports_sources_rsync.macports.org_release_ports_math_petsc/work/destroot/opt/local/lib/petsc --with-cc=/opt/local/bin/openmpicc --with-cxx=/opt/local/bin/openmpicxx --with-mpiexec=/opt/local/bin/openmpiexec --with-hdf5=1 --with-hdf5-dir=/opt/local --LIBS=-lsz --with-triangle=1 --with-triangle-dir=/opt/local --with-debugging=1 " returned error 1
:error:configure Target org.macports.configure returned: configure failure: shell command failed (see log for details)
:debug:configure Backtrace: configure failure: shell command failed (see log for details)
while executing
"$procedure $targetname"
:info:configure Warning: the following items did not execute (for petsc): org.macports.activate org.macports.configure org.macports.build org.macports.destroot org.macports.install
:notice:configure Log for petsc is at: /opt/local/var/macports/logs/_opt_local_var_macports_sources_rsync.macports.org_release_ports_math_petsc/main.log
Xcode 3.2.4でMac OS 10.6.5を実行しています。私のMacPortsバージョンは1.9.2最新のものです。
助けてください。
解決
あなたは反対しているかもしれません バグ#237223;追加 -lstdc++
に LDFLAGS
その場合は助けになるかもしれません。また、動作していることを確認してください gfortran
あなたの道で。 MacPortsのポートに対してバグを提出することも検討してください。
最後の行に記載されているログファイルは、テストを実行しているPythonファイルのコンテキストの一部と同様に、これを診断するのに役立ちます。でのインストールの試みからの出力 -d
と -v
に渡されたフラグ port
助けになるかもしれません。
所属していません StackOverflow