Eu não sei o Por quê parte, mas eu sei que você pode obter os nomes de linha por melt
a matrix
em vez de um data.frame
:
melt(as.matrix(dat))
# Var1 Var2 value
# 1 Cubn FOO 3.7145516
# 2 Gm9779 FOO 2.5605166
# 3 Apod FOO 3.5179670
# 4 Cubn BAR 0.2374546
# 5 Gm9779 BAR 0.2085075
# 6 Apod BAR 0.1959992
Você terá que olhar para o código para o melt
Funcionar para saber por que se comporta dessa maneira. Em particular, o código para reshape2:::melt.matrix
tem as seguintes linhas que criarão as duas primeiras colunas no exemplo acima:
labels <- expand.grid(lapply(dn, var.convert), KEEP.OUT.ATTRS = FALSE,
stringsAsFactors = FALSE)