Преобразовать только одну ось в масштаб Log10 с GGPLOT2

Question

У меня есть следующая проблема: я хотел бы визуализировать дискретную и непрерывную переменную на коробке, на котором последний имеет несколько крайних высоких значений. Это делает ящик бессмысленным (точки и даже «тело» диаграммы слишком маленькие), поэтому я хотел бы показать это в масштабе Log10. Я знаю, что я мог бы исключить экстремальные значения из визуализации, но я не намерен.

Давайте посмотрим простой пример с данными Diamonds:

m <- ggplot(diamonds, aes(y = price, x = color))

Проблема здесь не серьезна, но я надеюсь, что вы могли бы представить, почему я хотел бы увидеть значения в масштабе Log10. Давай попробуем:

m + geom_boxplot() + coord_trans(y = "log10")

Как видите, ось Y масштабирована log10 и выглядит нормально, но есть проблема с осью x, что делает сюжет очень странным.

Проблема не возникает с scale_log, но Это не вариант для меня, поскольку я не могу использовать пользовательский форматер таким образом. Например:

m + geom_boxplot() + scale_y_log10() 

Мой вопрос: кто -нибудь знает решение для построения построения ящика с помощью шкалы log10 на оси y, которая может быть свободно отформатирована с помощью formatter функционировать как в этом нить?

---

Редактирование вопроса, чтобы помочь ответам на основе ответов и комментариев:

То, что я на самом деле после: одна преобразованная ось log10 (y) с не научными этикетками. Я хотел бы назвать это как доллар (formatter=dollar) или любой пользовательский формат.

Если я попробую предложение @Хэдли, я получу следующие предупреждения:

> m + geom_boxplot() + scale_y_log10(formatter=dollar)
Warning messages:
1: In max(x) : no non-missing arguments to max; returning -Inf
2: In max(x) : no non-missing arguments to max; returning -Inf
3: In max(x) : no non-missing arguments to max; returning -Inf

С неизменными этикетками оси Y:

Answer 1

Самое простое - просто дать «транс» (ранее «форматер» аргумент имени функции журнала:

m + geom_boxplot() + scale_y_continuous(trans='log10')

Изменить: или если вам это не нравится, то любой из них, кажется, дает разные, но полезные результаты:

m <- ggplot(diamonds, aes(y = price, x = color), log="y")
m + geom_boxplot() 
m <- ggplot(diamonds, aes(y = price, x = color), log10="y")
m + geom_boxplot()

EDIT2 & 3: Дальнейшие эксперименты (после отказа от того, который пытался успешно поставить знаки «$» перед регистрационными значениями):

fmtExpLg10 <- function(x) paste(round_any(10^x/1000, 0.01) , "K $", sep="")
ggplot(diamonds, aes(color, log10(price))) + 
  geom_boxplot() + 
  scale_y_continuous("Price, log10-scaling", trans = fmtExpLg10)

Примечание добавлено в середине 2017 года в комментарии о изменении синтаксиса пакета:

scale_y_continoury (formatter = 'log10') теперь scale_y_continoury (trans = 'log10') (ggplot2 v2.2.1)

Answer 2

У меня была похожая проблема, и эта шкала сработала для меня, как очарование:

breaks = 10**(1:10)
scale_y_log10(breaks = breaks, labels = comma(breaks))

Поскольку вы хотите промежуточных уровней (10^3.5), вам нужно настроить форматирование:

breaks = 10**(1:10 * 0.5)
m <- ggplot(diamonds, aes(y = price, x = color)) + geom_boxplot()
m + scale_y_log10(breaks = breaks, labels = comma(breaks, digits = 1))

После выполнения ::

Answer 3

Другое решение с использованием scale_y_log10 с trans_breaks, trans_format а также annotation_logticks()

library(ggplot2)

m <- ggplot(diamonds, aes(y = price, x = color))

m + geom_boxplot() +
  scale_y_log10(
    breaks = scales::trans_breaks("log10", function(x) 10^x),
    labels = scales::trans_format("log10", scales::math_format(10^.x))
  ) +
  theme_bw() +
  annotation_logticks(sides = 'lr') +
  theme(panel.grid.minor = element_blank())

Answer 4

Я думаю, что получил это наконец, выполнив некоторые ручные преобразования с данными перед визуализацией:

d <- diamonds
# computing logarithm of prices
d$price <- log10(d$price)

И выработайте форматер, чтобы позже вычислить «назад» логарифмические данные:

formatBack <- function(x) 10^x 
# or with special formatter (here: "dollar")
formatBack <- function(x) paste(round(10^x, 2), "$", sep=' ') 

И нарисуйте сюжет с данным форматером:

m <- ggplot(d, aes(y = price, x = color))
m + geom_boxplot() + scale_y_continuous(formatter='formatBack')

Извините сообществу, чтобы беспокоить вас вопросом, который я мог бы решить раньше! Самое смешное: я усердно работал, чтобы сделать этот сюжет месяц назад, но не удалось. Спросил здесь, я понял.

В любом случае, спасибо @dwin за мотивацию!