Вы должны убедиться, что EE знает, где находятся ваши шаблоны.
Войдите в свою панель управления и перейдите к: Design -> Шаблоны -> Глобальные предпочтения
Измените настройки для Save Templates as Files
к Yes
а затем изменить Server path to site's templates
в место добавленных вами файлов шаблона.
Обычно я создавал новую папку: /themes/site_themes/myNewTheme
, тогда шаблоны будут храниться в /themes/site_themes/myNewTheme/default_site/
После изменения настройки перейдите к Design -> Шаблоны -> Синхронизировать шаблоны, выберите все шаблоны и нажмите «Отправить».
Надеюсь, это должно сделать свое дело :)