将numpy阵列转换为矩阵rpy2，kmeans

Question

我有一个numpy 2D阵列self.sub，我想在rpy2 kmeans中使用它。 k = brobjects.r.kmeans（self.sub，2,20），我总是会收到以下错误：valueerror：目前类型什么都没做！我能做些什么？

Answer 1

从rpy2 文档, ，r矩阵只是具有昏暗属性集的向量。因此，对于二维数组x

import rpy2.robjects as robj

nr, nc = x.shape
xvec = robj.FloatVector(x.transpose().reshape((x.size))
xr = robj.r.matrix(xvec, nrow=nr, ncol=nc)

您必须转置numpy数组，因为r通过列填充矩阵。

编辑：实际上，您可以在r矩阵函数中设置byrow = true，然后您无需转置即可。