题
我有一大堆的对数线性模型,这对于我们来说也只是glm()
对象称为mx, my, mz
的。我想越轨行为分析的一个很好的格式xtable
,所以很自然我会想执行xtable(anova(mx, my, mz, test = "Chisq"))
。
xtable
的香草输出,但是,不包括模型规格。我想包括所有我运行ANOVA测试,所以如果没有一个PARAM我缺少做这个我可能就不得不砍了自己的解决方案。但看在帮助页面,那里似乎没有一种简单的方法,包括型号规格。
任何想法?替代?
如果它有助于这是在完成2.9.1与xtable 1.5-5。
解决方案
如果a
是方差分析表对象,然后attr(a,"heading")
确实包含你正在寻找的信息,但我无法弄清楚它提取的一种很好的方式。所以,我抬头anova.glm
的代码,它指示我anova.lmlist
的代码,以弄清楚他们是如何把这些信息输入标题。这激发到下述溶液:
# fake data
x <- 1:10
y <- x+ rnorm(10)
# two models
m1 <- glm(y~x)
m2 <- glm(y~x+I(x^2))
a <- anova(m1, m2) # anova object to be printed
# get model formulas
flas <- sapply(list(m1,m2), function(x)paste(deparse(x$formula)))
rownames(a) <- flas # add formulas as rownames
# convert to latex
xtable(a)
修改,以满足长公式:强>结果
如果你有很长的公式,需要两个变化:首先我们要确保deparse
不分解成线,然后我们需要使乳胶包裹在表中的公式。第一可通过使用deparse的cutoff.width
参数,所述第二通过使用胶乳一个p{width}
列类型来实现。例如:
# add long formula
m2$formula <- freq ~ sex + attend + birth + politics + sex:attend + sex:birth +
sex:politics + attend:birth + attend:politics + birth:politics +
sex:attend:birth + sex:attend:politics + sex:birth:politics +
attend:birth:politics
a <- anova(m1, m2)
# use a large width
flas <- sapply(list(m1,m2),
function(x)paste(deparse(x$formula, cutoff.width=500)))
rownames(a) <- flas # add formulas as rownames
# convert to latex with first column wrapped in a 5cm wide parbox
xtable(a, align="p{5cm}rrrr")
结果是不是太漂亮,但你的公式是不漂亮任一。在我会用(sex + attend + birth + politics)^3
这种特殊情况下 - 得到跨越点和短得多。
其他提示
我觉得要得到LaTeX的表格,但你可以很容易地用HTML模型公式表。
# if we presuppose that <b>a</b> is object from @Aniko's reply
> class(a)
[1] "anova" "data.frame"
# after doing a bit of that sapply magic you get
> a
Analysis of Deviance Table
Model 1: y ~ x
Model 2: y ~ x + I(x^2)
Resid. Df Resid. Dev Df Deviance
y ~ x 8 15.503
y ~ x + I(x^2) 7 12.060 1 3.4428
您可以做这样的事情:
# load xtable library
library(xtable)
# sink output to html file
sink("~/anova_specs.html") # suppose you're running R on Linux "~/"
print(xtable(a), type = "html")
sink()
这不是漂亮乳胶表,但它有模型公式...
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