我怎样才能绘制NaN值作为一种特殊的颜色与matplotlib imshow？

Question

我想在matplotlib使用imshow到绘图数据，热图，但某些值是NaN的。我想要的NaN被呈现作为一种特殊的颜色在颜色表未找到。

示例：

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
f = plt.figure()
ax = f.add_subplot(111)
a = np.arange(25).reshape((5,5)).astype(float)
a[3,:] = np.nan
ax.imshow(a, interpolation='nearest')
f.canvas.draw()

将所得的图像是出乎意料的所有蓝色（在喷射colormap中最低的颜色）。但是，如果我做的绘图这样的：

ax.imshow(a, interpolation='nearest', vmin=0, vmax=24)

- 然后我得到更好的东西，但NaN值绘制的颜色相同VMIN ......有没有一种优雅的方式，我可以设置的NaN用一种特殊的颜色绘制（例如：灰色或透明的）？

Answer 1

HRM，它出现我可以使用掩蔽阵列做到这一点：

masked_array = np.ma.array (a, mask=np.isnan(a))
cmap = matplotlib.cm.jet
cmap.set_bad('white',1.)
ax.imshow(masked_array, interpolation='nearest', cmap=cmap)

这应该足够了，但我仍然开放的建议。 ：

Answer 2

使用Matplotlib的较新版本，则不必再使用一个掩蔽阵列。

例如，让我们产生阵列，其中每一个第七值是NaN：

arr = np.arange(100, dtype=float).reshape(10, 10)
arr[~(arr % 7).astype(bool)] = np.nan

我们可以修改当前的颜色表，并用下面的行绘制数组：

current_cmap = matplotlib.cm.get_cmap()
current_cmap.set_bad(color='red')
plt.imshow(arr)