在 R 编程中使用 S4 方法何时会带来回报

StackOverflow https://stackoverflow.com/questions/3602154

  •  25-09-2019
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题

我定期在专业环境中使用 R 进行编程，也为客户或同事编写程序包。这里的一些程序员有 Java 背景，坚持使用 S4 方法以面向对象的方式完成所有事情。另一方面，我的经验是，S4 实现通常性能更差，并且在尝试让代码执行您希望它执行的操作时会引起更多头痛。

我绝对同意，在某些情况下，您必须能够以受控方式构造复杂对象或附加现有对象。但大多数时候，S4 实现也可以使用经典列表轻松完成，而无需定义 standardGeneric、方法、构造函数、初始值设定项等麻烦。

您什么时候考虑为 R 编写 S4 实现？

编辑 ：为了清楚起见，我确实很欣赏 R 中关于 OO 的答案和讨论。在 R 中可以通过多种方式完成 OOP，但我的问题实际上是针对专门使用 S4 方法的附加值。

有帮助吗？

解决方案

我假设这并不直接适用于你，但如果你正在开发包Bioconductor的有使用S4，因为他们积极鼓励它的使用和拥有了十年的大部分时间，现在的激励 - 使所有芯包的大量使用S4的。

我觉得所有的额外开销是一个痛苦 - 在setGeneric，使用setMethod，涉及到命名空间，等等。话虽这么说，我觉得结构，它规定，可扩展性和其他类似的东西潜力是值得的。正如一切，也有涉及权衡。我认为它可以有很多清洁 - 我不喜欢怎么S3方法是简单地命名约定（让Foo.class）伪装。所有这一切是说，我倾向于避免在自己的代码大量使用S4除非我被告知这样做。

其他提示

我的经验是与你的线，所以我用S3只。

要澄清：S4有一些光滑特征（例如在多个参数和槽类型检查调度），但是我没有遇到的情况下的特征大于成本。成本的例子包括：任何时隙改变需要一个完整的对象复制和（可能更糟）正在进行的改变S4方法

总之，我喜欢背后S4的想法，但我会等待它在我自己的代码中使用它之前成熟。

好问题！我希望它能引起一些深思熟虑的讨论......

我从未使用过它，也不打算使用它，原因如下：

  1. 表现
  2. 我没有耐心完全理解S4以及它与S3的关系。
  3. 语法糖：我宁愿使用 object.method() 而不是 method(object)。

我喜欢糖，我还能说什么！

我为了延长空间（SP）类动物轨道数据了解到S4。这是最好的选择从可用的选项从头需要避免写的一切（最稳定的，一般和紧密匹配许多GIS定义）。我不觉得S4的繁重，很多人说，但现在我已经习惯了探索这样的对象的底层结构。性能也很好，我觉得可以做得很好，但做不好的时候也有性能陷阱。

如果空间数据是你的兴趣，spatstat是如何做了很多类似的事情，SP在S3中，虽然一个很好的例子（如看似一切空间。）有数据结构之间几乎没有干净的类比在不同的软件。

S4类在空间统计（意义上包sp）发挥强有力的一部分，从一种类型的数据转换到另一地方显得无缝的。这样做的缺陷是调试，这一直是我的经验，乏味的最好的。 到目前为止，我已经与S3管理，但可以考虑在未来使用S4。

随着时间的推移，事情变得周围有很多发挥，我相信他们将在至少由R的各个领域的核心功能很强的作用（这可能是空间分析，计量经济学，environmetrics ...）

不要忘记也有R.oo（CRAN上），它提供了R.做OO在我的脑海里的第三条道路，这提供一个面向对象的系统，该系统可能是程序员从其他系统迁移更熟悉 - 尤其是代替具有通用功能（使打印（富），然后必须在类Foo的调度）的方法是联系在一起的对象，所以你会做FOO $打印（） - 就像在Python或C ++，你会怎么做foo.print（）。

从前，Roxygen2不喜欢S4的方法。由于2017年（至少），它们一起工作。

我已经创建需要具有两个S3和S4的类的方法来工作的一些功能的不幸。它一直是令人难以置信的痛苦，以保持该代码多年来担任R型铁芯具有上多次改变细节如何将这些系统的交互，以及如何命名空间的工作，以及如何RCMD检查工作。

如果你不喜欢谷歌的风格指南，然后再考虑这些知名[R包开发者的意见，从这个线程上的 R-帮助

弗兰克勒尔 “如果你喜欢计算机科学比你更珍惜自己的时间，使用S4。”

特里Therneau写道： 对于90％的我做什么我强烈希望的松（S3），而不是刚性（S4）类....我S4的摘要VS S3

S4具有在大增量： 1.滋扰写 2.难以调试 3.写得很晦涩代码的能力 4.设计

S4收获： 5.以引导自动转换能力 6.验证一个类对象的内容

许可以下： CC-BY-SA 和 归因
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