You can use sed
if you want the line terminator as ,
.
$ cat myfile
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaffffffvbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbfaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa
$ sed -r 's/.{50}/&,\n/g' myfile
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa,
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaffffffvbbb,
bbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbfaaaaaa,
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa
fold
is another utility but won't add a ,
at the end
$ fold -w50 myfile
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaffffffvbbb
bbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbbfaaaaaa
aaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaa