Kontraste für lm mit Kontrastpaket

Question

Ich verwende das Paket contrast, um Kontraste für lm in R zu erstellen.Mit dem folgenden Code mache ich einen Kontrast zwischen Trt1 und Trt3.

Y <- c(10, 12, 14, 16, 9, 8)
Trt <- gl(n=3, k=2, length=3*2)
Data1 <- data.frame(Y, Trt)

Data1.lm <- lm(Y~Trt, data = Data1)

library(contrast)
Contrs1 <- contrast(Data1.lm, a=list(Trt="1"), b=list(Trt="3"), type = "average")
print(Contrs1, X=TRUE)

Ich möchte einen Kontrast zwischen dem Durchschnitt von (Trt1 und Trt2) und Trt3 herstellen.Ich habe diesen Code verwendet

Contrs2 <- contrast(Data1.lm, a=list(Trt="1", Trt="2"), b=list(Trt="3"), type = "average")
print(Contrs2, X=TRUE)

lm model parameter contrast

  Contrast     S.E.    Lower    Upper    t df Pr(>|t|)
1      6.5 1.224745 2.602315 10.39768 5.31  3   0.0131

Contrast coefficients:
  (Intercept) Trt2 Trt3
1           0    1   -1

Ich kann sehen, dass dies nicht der gewünschte Kontrast ist.Ich frage mich, wie man den richtigen Kontrast zum contrast-Paket in R erhält.Jede Hilfe in dieser Hinsicht wird sehr geschätzt.Danke

P.S.Ich weiß, dass ich die Kontrastmatrix für die aov-Funktion in R verwenden muss, aber für dieses spezielle Problem möchte ich das contrast-Paket verwenden.

Answer 1

Sie sollten die enthaltenen Behandlungsstufen als Vektor (Trt=c("1","2")) und nicht als Liste angeben.Ich habe dies anhand der Beispiele in ?contrast.lm herausgefunden (obwohl es zugegebenermaßen hilfreich ist, zu wissen, wonach Sie suchen):

Contrs2 <- contrast(Data1.lm, a=list(Trt=c("1","2")), b=list(Trt="3"),
                    type = "average")
print(Contrs2, X=TRUE)
## lm model parameter contrast
##   Contrast    S.E.    Lower    Upper    t df Pr(>|t|)
## 1      4.5 1.06066 1.124506 7.875494 4.24  3    0.024