Assoziationsmatrix von vegdist() in einen Datenrahmen umwandeln
Frage
Ich verwende das vegdist()
Funktion in der R-Paket vegan um eine Assoziationsmatrix für einen Artenhäufigkeitsdatensatz zu erstellen (die erstellte Assoziationsmatrix ist 936 x 936).Ich möchte in der Lage sein exportieren/extrahieren/erzwingen Diese Assoziationsmatrix in einen Datenrahmen oder ein beschreibbares Format umwandeln .csv damit ich es für spätere Analysen verwenden kann.Ich weiß, dass Sie die Ausgabe von verwenden können vegdist()
für Dinge wie die Ordination danach oder die Visualisierung mithilfe von Heatmaps (coldiss()
), aber in diesem Fall möchte ich tatsächlich in der Lage sein, die rohe Assoziationsmatrix zu sehen und zu manipulieren.
Irgendwelche Ideen?Ich war mir nicht sicher, ob Beispieldaten in diesem Fall wirklich helfen würden, da es sich um einen so großen Datensatz handelt.
Lösung
Versuchen:
write.csv(as.matrix(YOUR_MATRIX), "YOUR_MATRIX.csv")