Quantum und Molecular Dynamische Pakete und Queuing-Systeme [geschlossen]

Question

Von der extense Liste von Quantum und Molecular Dynamics-Paketen, die diejenigen leicht „miteinander verbunden“ werden können, zu einem Cluster, die mit den Warteschlangensystemen PBS und Sun Grid Engine funktioniert?

Oder ist es dort einig Programm oder eine Methode, die „Verpackung“, um alle Aufträge in einer PBS oder SGE Weise ermöglicht?

Danke

Answer 1

Ich werde sehr überrascht sein, wenn viele der Pakete auf Ihrer Liste können nicht einfach auf einem Cluster unter PBS, SGE oder beiden ausgeführt werden. Im einfachsten sind sie nur Batch-Job-Manager so, wenn Sie eine Befehlszeile der gewählte Programm schreiben können ausführen Sie einen Job Skript für die Einreichung schreiben können. Mit SGE, bin ich mit PBS nicht so vertraut sind, können Sie auch interaktive Jobs auf einem Cluster ausgeführt werden.

Sie wollen wahrscheinlich über die Ausführung parallel Versionen Ihrer Pakete unter PBS und SGE kennen. Auch hier sehr einfach das Paket, wenn (a) parallelisiert wird, und (b) der Cluster das Recht hat Parallelisierung System konfiguriert.

Wenn Sie spezifischere Fragen über bestimmte Pakete haben vielleicht, könnten versuchen, Sie wieder zu veröffentlichen, obwohl ich vermute, dass die Hersteller der Verpackung oder ihre Website, zu einem besseren Ort ist als SO zu starten.