Cualquier forma fácil de trazar una dispersión 3D en Python que pueda girar alrededor?

Question

Actualmente estoy usando matplotlib para trazar una dispersión 3D y mientras se hace el trabajo, me parece que no puede encontrar una manera de hacerlo girar para ver mejor mis datos.

Este es un ejemplo:

import pylab as p
import mpl_toolkits.mplot3d.axes3d as p3

#data is an ndarray with the necessary data and colors is an ndarray with
#'b', 'g' and 'r' to paint each point according to its class

...

fig=p.figure()
ax = p3.Axes3D(fig)
ax.scatter(data[:,0], data[:,2], data[:,3], c=colors)
ax.set_xlabel('X')
ax.set_ylabel('Y')
ax.set_zlabel('Z')
fig.add_axes(ax)
p.show()

Me gustaría una solución que me permite hacerlo durante el tiempo de ejecución, pero siempre que puedo girarlo y es corta / rápida, estoy bien con ella.

He aquí una comparación de los registros efectuados después de aplicar un PCA para el conjunto de datos del iris:
1. Mayavi
??
2. matplotlib

Mayavi hace que sea más fácil visualizar los datos, pero matplotlib se ve más profesional. Matplotlib también es más ligero.

Answer 1

Mayavi , puede crear un gráfico de este tipo con

import enthought.mayavi.mlab as mylab
import numpy as np
x, y, z, value = np.random.random((4, 40))
mylab.points3d(x, y, z, value)
mylab.show()

La GUI permite la rotación a través de hacer clic y arrastrar, y el zoom de entrada / salida a través de un clic derecho y arrastrando.

Answer 2

Bueno, primero que hay que definir lo que entendemos por "ver mejor mis datos" ...

Puede rotar y hacer zoom en la trama con el ratón, si usted está queriendo trabajar de forma interactiva.

Si acaba de querer girar los ejes mediante programación, a continuación, utilizar ax.view_init(elev, azim) donde elev y azim son los ángulos de elevación y azimut (en grados) que desee para ver su parcela de.

Como alternativa, puede utilizar los ax.elev, ax.azim y propiedades ax.dist para obtener / establecer la elevación, acimut y distancia del punto de vista actual.

Tomando prestado el fuente de este ejemplo :

import numpy as np
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import matplotlib.pyplot as plt

def randrange(n, vmin, vmax):
    return (vmax-vmin)*np.random.rand(n) + vmin

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
n = 100
for c, m, zl, zh in [('r', 'o', -50, -25), ('b', '^', -30, -5)]:
    xs = randrange(n, 23, 32)
    ys = randrange(n, 0, 100)
    zs = randrange(n, zl, zh)
    ax.scatter(xs, ys, zs, c=c, marker=m)

ax.set_xlabel('X Label')
ax.set_ylabel('Y Label')
ax.set_zlabel('Z Label')

plt.show()

conseguir un buen diagrama de dispersión:

Puede girar los ejes programáticamente como se muestra:

import numpy as np
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D
import matplotlib.pyplot as plt

def randrange(n, vmin, vmax):
    return (vmax-vmin)*np.random.rand(n) + vmin

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
n = 100
for c, m, zl, zh in [('r', 'o', -50, -25), ('b', '^', -30, -5)]:
    xs = randrange(n, 23, 32)
    ys = randrange(n, 0, 100)
    zs = randrange(n, zl, zh)
    ax.scatter(xs, ys, zs, c=c, marker=m)

ax.set_xlabel('X Label')
ax.set_ylabel('Y Label')
ax.set_zlabel('Z Label')

ax.azim = 200
ax.elev = -45

plt.show()

Espero que ayude un poco!