Simplemente mouse en un elemento y muévalo. El nivel de archivo o carpeta también se puede cambiar de esta manera. Puede hacer carpetas desde el Menubar: Archivo: Nuevo: Grupo ".
Veo que está utilizando referencias de carpetas, no grupos. Si no hay una razón específica para usar referencias de carpetas, cambie para usar grupos. Al arrastrar una carpeta de archivos, existe la opción de referencias o grupos de carpetas. Dado que las referencias de carpetas son un espejo de la estructura del directorio y no se pueden cambiar en Xcode. Sospecho que el OP realmente quiere grupos.
Cuando esté en la parte inferior, puede arrastrar horizontalmente para seleccionar el nivel para moverse. Ver imagen agregada.