Basta o mouse para baixo em um item e movê-lo. O nível de arquivo ou pasta também pode ser alterado dessa maneira. Você pode fazer pastas do Menubar: Arquivo: Novo: Grupo ".
Vejo que você está usando referências de pastas, não grupos. Se não houver motivo específico para usar as referências de pastas, altere os grupos de uso. Ao arrastar em uma pasta de arquivos, há a opção de referências ou grupos de pastas. Como as referências de pasta são um espelho da estrutura do diretório e não podem ser alteradas no Xcode. Eu suspeito que o OP realmente queira grupos.
Quando você estiver no fundo, pode arrastar horizontalmente para selecionar o nível para se mover. Veja a imagem adicionada.