Pregunta

Tengo la siguiente forma de enviar un trabajo con el clúster usando qsub:

 Submitting jobs from standard input
       To submit a PBS job by typing job specifications at the command line, the user types

              qsub [options] <return>

       then types any directives, then any tasks, followed by

              (in UNIX)     CTRL-D on a line by itself
              (in Windows)  CTRL-Z <return>

       to terminate the input.

¿Hay alguna manera de codificar RETURN y CTRL-D en el script bash para que podamos hacer algo como:

for i in path/*.txt; do echo "$i";  qsub [RETURN] /path2/mycode $i; [CTRL-D]; done
¿Fue útil?

Solución

Debe usar la redirección a través de tuberías:

for i in path/*.txt; do
  echo "$i";
  echo "/path2/mycode $i" | qsub;
done

Otros consejos

Pruebe echo / path2 / mycode $ i | qsub .

Si esto no funciona o necesita pasar datos más complejos, entonces esperar puede ayudar.

Solo para aclarar (dado que la respuesta de corvus es exactamente correcta) - CTRL-D solo significa "fin de archivo". o " final de entrada " ;, así que cuando repita ese texto en qsub, enviará automáticamente una señal de fin de archivo (que es lo mismo que presionar CTRL-D)

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