Clúster anidado en pydot

Question

Quiero organizar los nodos de tal manera que haya 2 grupos A y B.

B tiene más 2 grupos C y D.

Para lo mismo, escribí el siguiente programa en el que agrego 2 grupos dentro de uno y luego agrego el grupo B como un subgrafo en el gráfico principal.

Sin embargo, los cuadros anidados no aparecen.¿Alguien puede decirme qué estoy haciendo mal?

import pydot

def draw( ListA , ListB , ListC , filename ):
    graph = pydot.Dot(graph_type='digraph',fontsize = 50  )
    List_nodesA = []
    List_nodesB = []
    List_nodesC = []
    cluster1 = pydot.Cluster( "A" , color = ".3 .5 .7"  )
    cluster2 = pydot.Cluster( "D" , color = ".6 .5 .2"  )
    cluster3 = pydot.Cluster( "C" , color = ".7 .5 .9" )
    cluster4 = pydot.Cluster( "B" )
    for item in ListA:
        List_nodesA.append(pydot.Node(str( item ) , shape = "circle", style="filled", fillcolor="0.5 0.4 0.9" ))
    for item in ListB:
        List_nodesB.append(pydot.Node(str( item ) , shape = "circle", style="filled", fillcolor="orange"))
    for item in ListC:
        List_nodesC.append(pydot.Node(str( item ) , shape = "circle", style="filled", fillcolor="green"))

    for node in List_nodesA:
        cluster1.add_node( node )

    graph.add_subgraph( cluster1 )
    for node in List_nodesB:
        cluster2.add_node( node )  # create cluster D
    cluster4.add_subgraph( cluster2 ) # add it to B

    for node in List_nodesC:
        cluster3.add_node( node ) # create cluster C
    cluster4.add_subgraph( cluster3 ) # add it to B

    graph.add_subgraph( cluster4 )
    for vertex1 in List_nodesA:
        for vertex2 in List_nodesB:
            graph.add_edge( pydot.Edge( vertex1 , vertex2 , len=1.5 ) )

    graph.write(filename,prog = 'neato',format = 'png')

draw( [1,2] , [3,4] , [5,6] , "graph.png" )

Answer 1

Neato no admite clústeres, ya que utiliza un modelo de resorte donde la ubicación de los nodos es muy dinámica.Si reemplaza el motor neato con el motor dot, sus grupos aparecerán correctamente.