ffmpeg vs mencoder

Question

Estoy haciendo un montón de videos codificando una variedad de dispositivos y plataformas. Me he rebotado de ida y vuelta varias veces entre mencoder y ffmpeg. ¿Cuál recomienda y por qué?

Pregunta secundaria: de Google, parece que Mencoder usa FFMPEG. ¿Hace esto todo el tiempo o solo cuando lo considera necesario?