Textwrapping cadena larga en knitr de salida (RStudio)

Question

Tengo una larga vector de string (secuencia de ADN) de hasta un par de miles de caracteres secuenciales que quiero añadir a mi knitr informe de salida.RStudio maneja el ajuste de texto perfectamente en la consola, pero cuando puedo generar la knitr la salida de html sólo puedo ver una línea de texto y que sólo se ejecuta fuera de la página.

RStudio de salida

knitr de salida

Cualquier forma de ajuste de knitr de salida para ajustar el texto?

Gracias.

Answer 1

Yo lo recomiendo para probar la R Rebajas v2.El valor predeterminado de HTML de la plantilla hace el ajuste de texto para usted.Esto se logra con las definiciones CSS para las etiquetas HTML pre/code, por ejemplo, word-wrap: break-word; word-break: break-all;.Estas definiciones son en realidad de Arranque (en la actualidad rmarkdown utiliza Bootstrap 2.3.2).

Usted se sigue utilizando la primera versión de R de las Rebajas, a saber, la markdown paquete.Sin duda se puede lograr el mismo objetivo utilizando algunos CSS personalizado definiciones, y que sólo requiere que usted aprenda más acerca de HTML/CSS.

Otra solución es romper manualmente la larga cadena mediante la función str_break() Escribí a continuación:

A helper function `str_break()`:

```{r setup}
str_break = function(x, width = 80L) {
  n = nchar(x)
  if (n <= width) return(x)
  n1 = seq(1L, n, by = width)
  n2 = seq(width, n, by = width)
  if (n %% width != 0) n2 = c(n2, n)
  substring(x, n1, n2)
}
```

See if it works:

```{r test}
x = paste(sample(c('A', 'C', 'T', 'G'), 1000, replace = TRUE), collapse = '')
str_break(x)
cat(str_break(x), sep = '\n')
```