Pregunta

¿Alguien ha intentado compilar SciPy 0.7.1 en Windows utilizando numpy-1.3.0 que fue construido con las bibliotecas ATLAS pre-construidos (atlas3.6.0_WinNT_P4SSE2.zip) vinculados en el documento de instalación .

Me sale el siguiente error de vinculador, y no tienen ideas sobre cómo solucionar este problema.

$ python setup.py config --compiler=mingw32 build --compiler=mingw32 install --root=i
[...]
creating build\temp.win32-2.6\Release
creating build\temp.win32-2.6\Release\scipy
creating build\temp.win32-2.6\Release\scipy\integrate
compile options: '-DNO_ATLAS_INFO=2 -I"C:\Documents and Settings\apy\Application Data\Python\Python26\site-packages\numpy\core\inc
lude" -IC:\Python26\include -IC:\Python26\PC -c'
gcc -mno-cygwin -O2 -Wall -Wstrict-prototypes -DNO_ATLAS_INFO=2 -I"C:\Documents and Settings\apy\Application Data\Python\Python26\
site-packages\numpy\core\include" -IC:\Python26\include -IC:\Python26\PC -c scipy\integrate\_odepackmo
dule.c -o build\temp.win32-2.6\Release\scipy\integrate\_odepackmodule.o
C:\MinGW\bin\g77.exe -g -Wall -mno-cygwin -g -Wall -mno-cygwin -shared build\temp.win32-2.6\Release\scipy\integrate\_odepackmodule
.o -LC:\atlas3.6.0_WinNT_P4SSE2 -LC:\MinGW\lib -LC:\MinGW\lib\gcc\mingw32\3.4.5 -LC:\Python26\libs -LC:\Act
ivePython32Python26\PCbuild -Lbuild\temp.win32-2.6 -lodepack -llinpack_lite -lmach -latlas -lcblas -lf77blas -llapack -lpython26 -
lg2c -o build\lib.win32-2.6\scipy\integrate\_odepack.pyd
C:\atlas3.6.0_WinNT_P4SSE2/libf77blas.a(ATL_F77wrap_daxpy.o):ATL_F77wrap_axpy.c:(.text+0x3c): undefined reference to `ATL
_daxpy'
C:\atlas3.6.0_WinNT_P4SSE2/libf77blas.a(ATL_F77wrap_dscal.o):ATL_F77wrap_scal.c:(.text+0x26): undefined reference to `ATL
_dscal'
C:\atlas3.6.0_WinNT_P4SSE2/libf77blas.a(ATL_F77wrap_dcopy.o):ATL_F77wrap_copy.c:(.text+0x3d): undefined reference to `ATL
_dcopy'
C:\atlas3.6.0_WinNT_P4SSE2/libf77blas.a(ATL_F77wrap_idamax.o):ATL_F77wrap_amax.c:(.text+0x1e): undefined reference to `AT
L_idamax'
C:\atlas3.6.0_WinNT_P4SSE2/libf77blas.a(ATL_F77wrap_ddot.o):ATL_F77wrap_dot.c:(.text+0x36): undefined reference to `ATL_d
dot'
collect2: ld returned 1 exit status
error: Command "C:\MinGW\bin\g77.exe -g -Wall -mno-cygwin -g -Wall -mno-cygwin -shared build\temp.win32-2.6\Release\scipy\integrat
e\_odepackmodule.o -LC:\atlas3.6.0_WinNT_P4SSE2 -LC:\MinGW\lib -LC:\MinGW\lib\gcc\mingw32\3.4.5 -LC:\Python
26\libs -LC:\Python26\PCbuild -Lbuild\temp.win32-2.6 -lodepack -llinpack_lite -lmach -latlas -lcblas -lf77blas -llap
ack -lpython26 -lg2c -o build\lib.win32-2.6\scipy\integrate\_odepack.pyd" failed with exit status 1

¿Alguien sabe lo que podría haber ido mal aquí? Buscando ATL_daxpy, por ejemplo, en libf77blas.a como resultado:

$ strings libf77blas.a  | grep -i daxpy
_daxpy_
_atl_f77wrap_daxpy_
ATL_F77wrap_daxpy.o/
daxpy.o/        1081731936  1003  513   100755  420       `
daxpy.f
_daxpy_
_atl_f77wrap_daxpy_
_atl_f77wrap_daxpy_
_ATL_daxpy

Hay _ATL_daxpy, pero sin ATL_daxpy.

¿Fue útil?

Solución

Nuestros instrucciones de instalación son terriblemente fuera de fecha. En primer lugar, se debe utilizar el instalador binario a no ser que tenga una muy buena razón para no hacerlo en las ventanas. Aquí está vinculando contra un atlas que es diferente a la que numpy sí fue construido, lo cual es poco probable que funcione bien (numpy y scipy utilizarían diferentes versiones de Atlas).

Asumiendo que tiene una buena razón para construir por sí mismo, puede obtener los atlas binarios que utilizamos en los instaladores binarios en el directorio de proveedores de nuestro repositorio .

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