Otros consejos

Trate:

p <- gzcon(url("http://api.stackoverflow.com/0.9/stats/"))
readLines(p)

Lo ideal es que debe indicar al servidor que podemos manejar el contenido gzip, averiguar a través de la cabeceras HTTP que el contenido está codificado en realidad gzip y luego descomprimir sólo si es. La biblioteca Rcurl puede hacer esto:

library(Rcurl)
getURL("http://api.stackoverflow.com/0.9/stats/",
       .opts=list(encoding="identity,gzip")
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