Comme vous le dites, c'est un bug qui a à voir avec la traduction entre la couche Mayavi et la couche VTK. Mais pour l'instant, vous pouvez utiliser cet attribut:
>> ax=mlab.axes()
>> ax.axes.font_factor
1.5
>> ax.axes.font_factor=2
Cependant, il ne produit qu'une petite augmentation de taille, car elle rejette les valeurs supérieures à 2.