Choisir de manière interactive un emplacement de tracé dans R avec Shiny
https://stackoverflow.com//questions/22004155
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RussianQuestion
Je ne sais pas vraiment comment poser cette question, mais voilà :
J'utilise le package brillant dans R.Je produis actuellement un tracé ggplot2, ce qui est très bien.
J'aimerais tracer deux graphiques, l'un au-dessus de l'autre, pour comparer visuellement les différences entre eux.
Idéalement, j'aimerais pouvoir sélectionner la position de traçage (haut ou bas) avec un bouton radio.Au fur et à mesure que je modifie les entrées pour générer le tracé que j'obtiens déjà maintenant, il apparaîtra dans la position sélectionnée par les boutons radio haut/bas.
trim_down<-function(LAB,TYPE,FORM,CLASS,AMI,DATE){
ma<<-dft
if (is.nan(TYPE)==FALSE){ma<<-subset(ma, type %in% TYPE)}
if (is.nan(FORM)==FALSE){ma<<-subset(ma, form %in% FORM)}
if (is.nan(CLASS)==FALSE){ma<<-subset(ma, class %in% CLASS)}
if (is.nan(AMI)==FALSE){ma<<-subset(ma, ami %in% AMI)}
ma<<-subset(ma, as.Date(dateStarted,"%m/%d/%Y")>=DATE[1] )
ma<<-subset(ma, as.Date(dateStarted,"%m/%d/%Y")<=DATE[2] )
dim(ma)
ma<<-ma[,-(1:length(test_factors))]
all_test_names<<-names(ma)
ma<<-as.matrix(ma)
ma<<-t(apply(ma, 1,as.numeric,na.rm=TRUE))
aa<<-1-colMeans(ma,na.rm=TRUE)
b<<-colSums(!is.na(ma))
active_test_names<<-all_test_names[!is.nan(aa)]
x<<-rbind(aa,b)
graph.me(x,all_test_names,active_test_names,trimmed_up=FALSE)
}
graph.me<-function(x,all_test_names,active_test_names,trimmed_up=TRUE){
library(reshape2)
aa<<-x[1,]
b<<-x[2,]
aa[aa==0]=-.1
aa[is.na(aa)]=0
XAXIS<<-all_test_names
success <- as.data.frame(aa)
rownames(success)<-XAXIS
samples <- as.data.frame(b)
data.long <- cbind(melt(success,id=1), melt(samples, id=1))
names(data.long) <- c("success", "count")
rownames(data.long)<-XAXIS
threshold <- 25
data.long$fill <- with(data.long,ifelse(count>threshold,max(count),count))
data.long$fill[data.long$fill>threshold]<-threshold
library(ggplot2)
library(RColorBrewer)
print(ggplot(data.long) +
geom_bar(aes(x=XAXIS, y=success, fill=fill),colour="grey70",stat="identity")+
scale_fill_gradientn(colours=brewer.pal(9,"RdYlGn")) +
theme(axis.text.x=element_text(angle=-90,hjust=0,vjust=0.4)))
}
ui.r
library(shiny)
# Define UI for miles per gallon application
shinyUI(pageWithSidebar(
# Application title
headerPanel("Example"),
sidebarPanel(
# checkboxGroupInput("_lab", "lab:",unique(dft$lab)),
checkboxGroupInput("type", "Type:",unique(dft$type),selected=unique(dft$type)),
checkboxGroupInput("form", "Form:",unique(dft$form),selected=unique(dft$form)),
checkboxGroupInput("class", "Class:",unique(dft$class),selected=unique(dft$class)),
checkboxGroupInput("ami", "AMI:",unique(dft$ami),selected=unique(dft$ami)),
dateRangeInput("daterange", "Date range:",
start = min(as.Date(dft$date,"%m/%d/%Y")),
end = max(as.Date(dft$date,"%m/%d/%Y")))
),
mainPanel(
h3(textOutput("caption")),
plotOutput("Plot")
)
))
server.r
library(shiny)
shinyServer(function(input, output) {
# Compute the forumla text in a reactive expression since it is
# shared by the output$caption and output$mpgPlot expressions
formulaText <- reactive({
paste(input$type,input$form,input$class,input$ami)
})
# Return the formula text for printing as a caption
output$caption <- renderText({
formulaText()
})
# Generate a plot of the requested variable against mpg and only
# include outliers if requested
output$Plot <- renderPlot(function(){
print(trim_down(NA,input$type,input$form,input$class,input$ami,input$daterange))
})
})
Merci pour l'aide... Désolé pour autant de code, mais je ne suis pas sûr de ce qu'il est possible d'omettre en toute sécurité pour l'examen de tout le monde.Si cela peut aider, je pense que le problème pourrait être résolu en abordant ggplot pour tracer sur une grille de mise en page... Par exemple, grid.arrange() qui est piloté par un bouton radio pour le haut ou le bas ?
Sur la base d'une réponse, j'ai essayé ceci:
ui.r
library(shiny)
shinyUI(pageWithSidebar(
# Application title
headerPanel("Example"),
sidebarPanel(
radioButtons("plotSpot", "Position", c(1,2)),
checkboxGroupInput("type", "Type:",unique(dft$type),selected=unique(dft$type)),
checkboxGroupInput("form", "Form:",unique(dft$form),selected=unique(dft$form)),
checkboxGroupInput("class", "Class:",unique(dft$class),selected=unique(dft$class)),
checkboxGroupInput("ami", "AMI:",unique(dft$ami),selected=unique(dft$ami)),
dateRangeInput("daterange", "Date range:",
start = min(as.Date(dft$date,"%m/%d/%Y")),
end = max(as.Date(dft$date,"%m/%d/%Y")))
),
mainPanel(
plotOutput("topPlot"),
plotOutput("bottomPlot")
)
))
server.r
library(shiny)
p<-list()
output$Plot <- renderPlot({
p[input$plotSpot]<-trim_down(NA,input$type,input$form,input$class,input$ami,input$daterange)
output$topPlot <- renderPlot(ifelse(input$position == "Top", print(p[1]), print(p[2])))
output$bottomPlot <- renderPlot(ifelse(input$position == "Top", print(p[2]), print(p[1])))
})
})
Mais cela ne fait qu’un seul graphique.Je pensais que changer les indices de la liste qui contient le ggplot, puis conserver le même ordre dans lequel ils sont représentés graphiquement ferait l'affaire, mais pas de chance.
La solution
OK, je n'allais pas parcourir tout ce code, mais voici un exemple qui peut faire ce que vous voulez.Si j'ai mal compris, essayez de republier avec un minimal Par exemple, cela ramène tout au problème que vous abordez.
ui.R
library(shiny)
shinyUI(pageWithSidebar(
headerPanel("Plot position"),
sidebarPanel(
radioButtons("position", "Position", c("Top", "Bottom"))),
mainPanel(
plotOutput("topPlot"),
plotOutput("bottomPlot"))))
serveur.R
library(shiny)
library(ggplot2)
dat <- data.frame(A = 1:10, B = rnorm(10))
shinyServer(function(input, output) {
p1 <- ggplot(dat, aes(A, B)) + geom_point(colour = "red")
p2 <- ggplot(dat, aes(A, B)) + geom_path(colour = "blue")
output$topPlot <- renderPlot(ifelse(input$position == "Top", print(p1), print(p2)))
output$bottomPlot <- renderPlot(ifelse(input$position == "Top", print(p2), print(p1)))
})
Modifier
Selon votre nouvelle description du problème, les éléments suivants peuvent vous aider.Je pense que vous compliquez les choses - si les paramètres doivent être différents pour les différentes parcelles, ayez des entrées pour chacune des différentes parcelles.Il serait possible de n’avoir qu’un seul ensemble, mais cela augmenterait considérablement la complexité.
ui.R
library(shiny)
shinyUI(pageWithSidebar(
headerPanel("Plot position"),
sidebarPanel(
h2("Top plot settings"),
radioButtons("topPlotColour", "Colour:",
list("Blue" = "blue",
"Red" = "red")),
radioButtons("topPlotGeom", "Geom:",
list("Point" = "point",
"Line" = "line")),
h2("Bottom plot settings"),
radioButtons("bottomPlotColour", "Colour:",
list("Blue" = "blue",
"Red" = "red")),
radioButtons("bottomPlotGeom", "Geom:",
list("Point" = "point",
"Line" = "line"))),
mainPanel(
plotOutput("topPlot"),
plotOutput("bottomPlot"))))
serveur.R
library(shiny)
library(ggplot2)
dat <- data.frame(A = 1:10, B = rnorm(10))
shinyServer(function(input, output) {
p1_geom <-reactive({
geom <- switch(input$topPlotGeom,
point = geom_point(colour = input$topPlotColour),
line = geom_line(colour = input$topPlotColour))
})
p2_geom <-reactive({
geom <- switch(input$bottomPlotGeom,
point = geom_point(colour = input$bottomPlotColour),
line = geom_line(colour = input$bottomPlotColour))
})
p1_colour <- reactive({input$topPlotColour})
output$topPlot <- renderPlot({print(ggplot(dat, aes(A, B), colour = p1_colour()) + p1_geom())})
output$bottomPlot <- renderPlot(print(ggplot(dat, aes(A, B), colour = toString(quote(input$bottomPlotColour))) + p2_geom()))
})
