Contraindre la matrice d'association de vegdist() dans une trame de données

StackOverflow https://stackoverflow.com//questions/20049980

  •  26-12-2019
  •  | 
  •  

Question

J'utilise le vegdist() fonctionner dans le Forfait R végétalien pour générer une matrice d'association pour un ensemble de données sur l'abondance des espèces (la matrice d'association produite est de 936 par 936).je veux pouvoir exporter/extraire/contraindre cette matrice d'association dans une trame de données ou un format inscriptible en tant que .csv afin que je puisse l'utiliser pour des analyses ultérieures.Je sais que vous pouvez utiliser la sortie de vegdist() pour des choses comme l'ordination après, ou visualisez à l'aide de cartes thermiques (coldiss()), mais dans ce cas, je veux réellement pouvoir voir et manipuler la matrice d'association brute.

Des idées?Je n'étais pas sûr que des exemples de données seraient vraiment utiles dans ce cas, car il s'agit d'un ensemble de données très volumineux.

Était-ce utile?

La solution

Essayer:

write.csv(as.matrix(YOUR_MATRIX), "YOUR_MATRIX.csv")
Licencié sous: CC-BY-SA avec attribution
Non affilié à StackOverflow
scroll top