Python Matplotlib binning rectangulaire

Question

J'ai une série de (x, y) des valeurs que je veux tracer un histogramme 2d de l'utilisation de matplotlib de python. En utilisant hexbin, je reçois quelque chose comme ceci: Mais je cherche quelque chose comme ceci: Exemple de code:

from matplotlib import pyplot as plt
import random

foo = lambda : random.gauss(0.0,1.0)

x = [foo() for i in xrange(5000)]
y = [foo() for i in xrange(5000)]

pairs = zip(x,y)

#using hexbin I supply the x,y series and it does the binning for me
hexfig = plt.figure()
hexplt = hexfig.add_subplot(1,1,1)
hexplt.hexbin(x, y, gridsize = 20)

#to use imshow I have to bin the data myself
def histBin(pairsData,xbins,ybins=None):
    if (ybins == None): ybins = xbins
    xdata, ydata = zip(*pairsData)
    xmin,xmax = min(xdata),max(xdata)
    xwidth = xmax-xmin
    ymin,ymax = min(ydata),max(ydata)
    ywidth = ymax-ymin
    def xbin(xval):
        xbin = int(xbins*(xval-xmin)/xwidth)
        return max(min(xbin,xbins-1),0)
    def ybin(yval):
        ybin = int(ybins*(yval-ymin)/ywidth)
        return max(min(ybin,ybins-1),0)
    hist = [[0 for x in xrange(xbins)] for y in xrange(ybins)]
    for x,y in pairsData:
        hist[ybin(y)][xbin(x)] += 1
    extent = (xmin,xmax,ymin,ymax)
    return hist,extent

#plot using imshow
imdata,extent = histBin(pairs,20)
imfig = plt.figure()
implt = imfig.add_subplot(1,1,1)
implt.imshow(imdata,extent = extent, interpolation = 'nearest')

plt.draw()
plt.show()

Il semble que il devrait déjà être un moyen de le faire sans écrire ma propre méthode « binning » et en utilisant imshow.

Answer 1

Numpy a une fonction appelée histogram2d , dont docstring vous montre également comment le visualiser en utilisant Matplotlib. Ajouter interpolation=nearest à l'appel imshow pour désactiver l'interpolation.

Answer 2

Je me rends compte qu'il ya un patch soumis à Matplotlib, mais j'adopté le code de l'autre exemple pour accomoder quelques besoins que j'avais.

maintenant l'histogramme est tracée à partir du coin inférieur gauche, comme dans les mathématiques classiques (non informatique)

En outre, les valeurs en dehors de la plage de binning sont ignorés et j'utiliser un tableau 2d numpy pour le tableau à deux dimensions

I changé l'entrée de données à partir de paires de deux tableaux 1D puisque ceci est la quantité de données est fourni à disperser (x, y) et des fonctions semblables

def histBin(x,y,x_range=(0.0,1.0),y_range=(0.0,1.0),xbins=10,ybins=None):
    """ Helper function to do 2D histogram binning
        x, y are  lists / 2D arrays 
        x_range and yrange define the range of the plot similar to the hist(range=...) 
        xbins,ybins are the number of bins within this range.
    """

    pairsData = zip(x,y)

    if (ybins == None):
        ybins = xbins
    xdata, ydata = zip(*pairsData)
    xmin,xmax = x_range
    xmin = float(xmin)
    xmax = float(xmax)

    xwidth = xmax-xmin
    ymin,ymax = y_range    
    ymin = float(ymin)
    ymax = float(ymax)
    ywidth = ymax-ymin

    def xbin(xval):
        return floor(xbins*(xval-xmin)/xwidth) if xmin <= xval  < xmax else xbins-1 if xval ==xmax else None


    def ybin(yval):
        return floor(ybins*(yval-ymin)/ywidth) if ymin <= yval  < ymax else ybins-1 if yval ==ymax else None

    hist = numpy.zeros((xbins,ybins)) 
    for x,y in pairsData:
        i_x,i_y = xbin(x),ybin(ymax-y)
        if i_x is not None and i_y is not None:
            hist[i_y,i_x] += 1 

    extent = (xmin,xmax,ymin,ymax)

    return hist,extent

Answer 3

Je viens de soumettre une demande de traction pour cette https://github.com/matplotlib/matplotlib/ tirer / 805 . Si tout va bien, il sera accepté.

Answer 4

est matplotlib.pyplot.hist ce que vous cherchez?

>>> help(matplotlib.pyplot.hist)
Help on function hist in module matplotlib.pyplot:

hist(x, bins=10, range=None, normed=False, weights=None, cumulative=False, botto
m=None, histtype='bar', align='mid', orientation='vertical', rwidth=None, log=Fa
lse, hold=None, **kwargs)
    call signature::

      hist(x, bins=10, range=None, normed=False, cumulative=False,
           bottom=None, histtype='bar', align='mid',
           orientation='vertical', rwidth=None, log=False, **kwargs)

    Compute and draw the histogram of *x*. The return value is a
    tuple (*n*, *bins*, *patches*) or ([*n0*, *n1*, ...], *bins*,
    [*patches0*, *patches1*,...]) if the input contains multiple
    data.

Answer 5

Utilisez xlim et ylim pour définir les limites de la parcelle. xlim(-3, 3) et ylim(-3, 3) devraient le faire.