Domanda

Nuovo per la programmazione pthread, e bloccato su questo errore quando si lavora su un C ++ & C codice misto.

Quello che ho fatto è quello di chiamare il codice C nel thread creato dal codice C ++. C'è una statica booleana puntatore is_center utilizzato nel thread e dovrebbe ottenuto libero quando le finiture filo.

Comunque ho notato che ogni volta che quando il programma trasformato in funzione c, il valore del puntatore booleano sarebbe cambiato e l'errore di segmentazione poi è accaduto a causa del free (). E il problema si verifica solo quando si utilizza il codice c. Rimuovere il codice c e multi-thread c ++ parte funziona bene.

Codice dettaglio è il seguente:

static bool *is_center;

// omit other codes in between ...

void streamCluster( PStream* stream)
{
    // some code here ...
    while(1){
        // some code here ...
        is_center = (bool*)calloc(points.num,sizeof(bool));

        // start the parallel thread here.
        // the c code is invoked in this function.
        localSearch(&points,kmin, kmax,&kfinal); // parallel

        free(is_center);
    }

E la funzione utilizzando in parallelo è la seguente (il mio codice c viene richiamato in ogni thread):

void localSearch( Points* points, long kmin, long kmax, long* kfinal ) {
    pthread_barrier_t barrier;
    pthread_t* threads = new pthread_t[nproc];
    pkmedian_arg_t* arg = new pkmedian_arg_t[nproc];

    pthread_barrier_init(&barrier,NULL,nproc);

    for( int i = 0; i < nproc; i++ ) {
            arg[i].points = points;
            arg[i].kmin = kmin;
            arg[i].kmax = kmax;
            arg[i].pid = i;
            arg[i].kfinal = kfinal;
            arg[i].barrier = &barrier;

            pthread_create(threads+i,NULL,localSearchSub,(void*)&arg[i]);
    }

    for ( int i = 0; i < nproc; i++) {
        pthread_join(threads[i],NULL);
    }

    delete[] threads;
    delete[] arg;
    pthread_barrier_destroy(&barrier);
}

Infine, la funzione di chiamata il mio codice C:

void* localSearchSub(void* arg_) {                                                                                                                                                        

    int eventSet = PAPI_NULL;                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     
    begin_papi_thread(&eventSet);                                                                                                                                                         

    pkmedian_arg_t* arg= (pkmedian_arg_t*)arg_;                                                                                                                                             
    pkmedian(arg->points,arg->kmin,arg->kmax,arg->kfinal,arg->pid,arg->barrier);                                                                                                            

    end_papi_thread(&eventSet);                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 

    return NULL;                                                                                                                                                                            
}   

E da gdb, quello che ho ottenuto per il is_center è:

Breakpoint 2, localSearchSub (arg_=0x600000000000bc40) at streamcluster.cpp:1711
1711      end_papi_thread(&eventSet);
(gdb) s

Hardware watchpoint 1: is_center

Old value = (bool *) 0x600000000000bba0
New value = (bool *) 0xa93f3
0x400000000000d8d1 in localSearchSub (arg_=0x600000000000bc40) at streamcluster.cpp:1711
1711      end_papi_thread(&eventSet);

Qualche suggerimento? Grazie in anticipo!

Alcuni nuove informazioni relative al codice: per il codice C, sto usando il pacchetto PAPI. Scrivo il mio involucro papi per inizializzare e leggere i contatori di sistema. Il codice è il seguente:

void begin_papi_thread(int* eventSet)                                                                                                                                                     
{                                                                                                                                                                                         
    int thread_id = pthread_self();                                                                                                                                                       
    // Events                                                                                                                                                                             
    if (PAPI_create_eventset(eventSet)) {                                                                                                                                                 
        PAPI_perror(return_value, error_string, PAPI_MAX_STR_LEN);                                                                                                                        
        printf("*** ERROR *** Failed to create event set for thread %d: %s\n.", thread_id, error_string);                                                                                 
    }                                                                                                                                                                                     
    if((return_value = PAPI_add_events(*eventSet, event_code, event_num)) != PAPI_OK)                                                                                                     
    {                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        
        printf("*** ERROR *** Failed to add event for thread %d: %d.\n", thread_id, return_value);                                                                                                                                                                                                                                                                         
    }                                                                                                                                                                                     
    // Start counting                                                                                                                                                                     
    if ((return_value = PAPI_start(*eventSet)) != PAPI_OK) {                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
        PAPI_perror(return_value, error_string, PAPI_MAX_STR_LEN);                                                                                                                                                                                                                                                                                                         
        printf("*** ERROR *** PAPI failed to start the event for thread %d: %s.\n", thread_id, error_string);
    }                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             
}  
void end_papi_thread(int* eventSet)                                                                                                                                                       
{                                                                                                                                                                                         
    int thread_id = pthread_self();                                                                                                                                                       
    int i;                                                                                                                                                                                

    long long * count_values = (long long*)malloc(sizeof(long long) * event_num);                                                                                                         
    if (PAPI_read(*eventSet, count_values) != PAPI_OK)                                                                                                                                    
        printf("*** ERROR *** Failed to load count values.\n");                                                                                                                           

    if (PAPI_stop(*eventSet, &dummy_values) != PAPI_OK) {
        PAPI_perror(return_value, error_string, PAPI_MAX_STR_LEN);
        printf("*** ERROR *** PAPI failed to stop the event for thread %d: %s.\n", thread_id, error_string);
        return;
    }
    if(PAPI_cleanup_eventset(*eventSet) != PAPI_OK)
        printf("*** ERROR *** Clean up failed for the thread %d.\n", thread_id);                                                                                                          
} 
È stato utile?

Soluzione

Non credo che hai postato abbastanza il codice per capire veramente il problema, ma sembra sospetto che hai dichiarato is_center globale. Presumo che si sta utilizzando in più di un luogo, forse da più thread (localSearchSub ne parla, che è la funzione thread di lavoro).

Se is_center viene letto o scritto da più thread, probabilmente avrete bisogno di proteggerlo con una pthread mutex . Si dice che è "liberata quando le finiture filo", ma si deve essere consapevoli che ci sono discussioni nprocs, e sembra come se fossero tutti di lavoro su una serie di Caccio is_center[points]. Se points != nproc, questo potrebbe B e una brutta cosa [1]. Ogni filo deve probabilmente lavoro sulla propria matrice e localSearch dovrebbe aggregare i risultati.

Le funzioni xxx_papi_thread non si ottiene alcun risultato su Google, quindi posso solo immaginare che sia proprio ... improbabile che saremo in grado di aiutarti, se il problema è lì:)

[1]: Anche se points == nproc, non è necessariamente OK per scrivere a diversi elementi di una matrice da più thread (è compilatore e processore dipendente). Essere sicuri, utilizzare un mutex.

Inoltre, questo è C++ tag. Si può sostituire le matrici calloc e dinamici (utilizzando new) con vectors? Si potrebbe finire più facile per eseguire il debug, e finisce certamente all'altezza più facile da mantenere. Perché odi e vuole punire i lettori del tuo codice? ;)

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