Come tracciare i dendrogrammi con set di dati di grandi dimensioni?
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29-10-2019 - |
Domanda
Sto usando il pacchetto APE (analisi del pacchetto filogenetico ed evoluzione) in R che ha funzionalità di disegno del dendrogramma. Uso i seguenti comandi per leggere i dati in formato Newick e disegnare un dendrogramma usando la funzione del diagramma:
library("ape")
gcPhylo <-read.tree(file = "gc.tree")
plot(gcPhylo, show.node.label = TRUE)
Poiché il set di dati è abbastanza grande, è impossibile vedere qualsiasi dettaglio nei livelli più bassi dell'albero. Vedo solo aree nere ma senza dettagli. Riesco a vedere solo pochi livelli dall'alto, e poi nessun dettaglio.
Mi chiedevo se esiste una capacità di zoom della funzione della trama. Ho cercato di limitare l'area usando Xlim e Ylim, tuttavia limitano l'area e non zoom per rendere visibili i dettagli. O zooming o rendere visibili i dettagli senza ingrandire risolverà il mio problema.
Sono anche apprezzato nel conoscere qualsiasi altro pacchetto, funzione o strumento che mi aiuterà a superare il problema.
Grazie.
Nessuna soluzione corretta