OSX, G/AWK, BASH - "Dichiarazione illegale, stringa non terminata" e nessun output di file

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  •  26-09-2019
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Domanda

Ho una sceneggiatura che qualcuno di così gentile ha fornito per risolvere un problema che stavo avendo, tuttavia, ho alcuni problemi a farlo lavorare su OSX.

gawk --version
GNU Awk 3.1.6

awk --version
awk version 20100208

La fonte originale è:

awk -F, -vOFS=, -vc=1 '
NR == 1 {
    for (i=1; i<NF; i++) {
        if ($i != "") {
            g[c]=i;
            f[c++]=$i
        }
    }
}
NR>2 {
    for (i=1; i < c; i++) {
        print $1,$2, $g[i] > "output_"f[i]".csv
    }
}' data.csv

Quando eseguo lo script fornisce il seguente errore:

awk: syntax error at source line 12
context is print $1,$2, $g[i] > >>>  "output_"f <<< [i]".csv
awk: illegal statement at source line 13

Dall'aspetto di esso la variabile di [i] non è stata modificata nel file di output, ma non so perché.

Se cambio awk a Gawk ed eseguo lo script originale ecco l'output:

gawk: cmd. line:11:             print $1,$2, $g[i] > "output_"f[i]".csv
gawk: cmd. line:11:                                               ^ unterminated string

Quindi modifico la riga pertinente per correggere la stringa non terminata

print $1,$2, $g[i] > "output_"f[i]".csv"

Quindi funziona attraverso Fine non produce errori, ma non ci sono file di output.

Qualche idea? Ho trascorso la maggior parte della scorsa notte e questa mattina mi sono riversato su questo.

Un file di input di esempio:

,,L1,,,L2,,,L3,,,L4,,,L5,,,L6,,,L7,,,L8,,,L9,,,L10,,,L11,
Title,r/t,needed,actual,Inst,needed,actual,Inst,needed,actual,Inst,needed,actual,Inst,neede d,actual,Inst,needed,actual,Inst,needed,actual,Inst,needed,actual,Inst,needed,actual,Inst,needed,actual,Inst,needed,actual,Inst
EXAMPLEfoo,60,6,6,6,0,0,0,0,0,0,6,6,6,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0
EXAMPLEbar,30,6,6,12,6,7,14,6,6,12,6,6,12,6,8,16,6,7,14,6,7.5,15,6,6,12,6,8,16,6,0,0,6,7,14
EXAMPLE1,60,3,3,3,3,5,5,3,4,4,3,3,3,3,6,6,3,4,4,3,3,3,3,4,4,3,8,8,3,0,0,3,4,4
EXAMPLE2,120,6,6,3,0,0,0,6,8,4,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0
EXAMPLE3,60,6,6,6,6,8,8,6,6,6,6,6,6,0,0,0,0,0,0,6,8,8,6,6,6,0,0,0,0,0,0,0,10,10
EXAMPLE4,30,6,6,12,6,7,14,6,6,12,6,6,12,3,5.5,11,6,7.5,15,6,6,12,6,0,0,6,9,18,6,0,0,6,6.5,13

E l'esempio out put dovrebbe essere

Quindi per L1 un esempio out un aspetto sarebbe:

EXAMPLEfoo,60,6
EXAMPLEbar,30,6
EXAMPLE1,60,3
EXAMPLE2,120,6
EXAMPLE3,60,6
EXAMPLE4,30,6

E per L2:

EXAMPLEfoo,60,0
EXAMPLEbar,30,6
EXAMPLE1,60,3
EXAMPLE2,120,0
EXAMPLE3,60,6
EXAMPLE4,30,6
È stato utile?

Soluzione

Vedo due problemi (sulla piattaforma OS X):

  1. Il comando AWK su OS X non supporta il flag -v. Possiamo risolverlo usando il modello iniziale.
  2. L'OS X AWK non piace il modo in cui il file di output costruito nella riga di stampa.

Ecco la mia soluzione, che sembra funzionare sia su Mac OS X Snow Leopard e Red Hat Linux 4.x:

awk -F, '
BEGIN { OFS=","; c=1 } # FIX problem 1
NR == 1 {
    for (i=1; i<NF; i++) {
        if ($i != "") {
            g[c]=i;
            f[c++]=$i
        }
    }
}
NR>2 {
    for (i=1; i < c; i++) {
        outfile=sprintf("output_%s.csv", f[i]) # FIX problem 2
        print $1,$2, $g[i] > outfile
    }
}' data.csv
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