一時ファイルを作成せずにCで読み取るためにgzip圧縮ファイルを開く

StackOverflow https://stackoverflow.com/questions/1820144

  •  10-07-2019
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質問

fopenとfscanfを介してCで読み取りたいgzip圧縮ファイルがいくつかあります。ファイルを一時ファイルに圧縮することなくこれを行う方法はありますか？

ありがとう。

役に立ちましたか？

解決

libzlibを使用して、gzip圧縮されたファイルを直接開くことができます。

また、「gzopen」も提供しています。 fopenと同様に動作するが、gzip圧縮されたファイルで動作する関数。ただし、fscanfは通常のFILEポインターを想定しているため、このようなハンドルではおそらく動作しません。

他のヒント

popen が公正なゲームである場合、 fopen および fscanf を使用して実行できます。

#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <string.h>
#include <errno.h>

int main(int argc, char *argv[])
{
  const char prefix[] = "zcat ";
  const char *arg;
  char *cmd;
  FILE *in;
  char buf[4096];

  if (argc != 2) {
    fprintf(stderr, "Usage: %s file\n", argv[0]);
    return 1;
  }

  arg = argv[1];
  cmd = malloc(sizeof(prefix) + strlen(arg) + 1);
  if (!cmd) {
    fprintf(stderr, "%s: malloc: %s\n", argv[0], strerror(errno));
    return 1;
  }

  sprintf(cmd, "%s%s", prefix, arg);

  in = popen(cmd, "r");
  if (!in) {
    fprintf(stderr, "%s: popen: %s\n", argv[0], strerror(errno));
    return 1;
  }

  while (fscanf(in, "%s", buf) == 1)
    printf("%s: got [%s]\n", argv[0], buf);

  if (ferror(in)) {
    fprintf(stderr, "%s: fread: %s\n", argv[0], strerror(errno));
    return 1;
  }
  else if (!feof(in)) {
    fprintf(stderr, "%s: %s: unconsumed input\n", argv[0], argv[1]);
    return 1;
  }

  return 0;
}

例：

$ zcat file.gz
Every good boy does fine.
$ ./gzread file.gz
./gzread: got [Every]
./gzread: got [good]
./gzread: got [boy]
./gzread: got [does]
./gzread: got [fine.]

使用しないでください

sprintf(cmd, "zcat %s", argv[1]);
popen(cmd,"r");

.gzファイルを開きます。代わりにargv [1]を適切にエスケープしてください。そうしないと、特に一部が

などの引数argv [1]を注入する場合に脆弱性が発生する可能性があります 
123;rm -rf /

上記の指示を

に変更すると、すでに役立ちます 
sprintf(cmd, "zcat \'%s\'",argv[1]);

「\ 0」、「\」、「\;」などの文字をエスケープすることもできますなど。

gzscanf（）での新規試行：

#include <stdio.h>
#include <stdarg.h>
#include <zlib.h>

#define MAXLEN 256

int gzscanf(gzFile *stream, const char *fmt, ...) {
  /* read one line from stream (up to newline) and parse with sscanf */
  va_list args;
  va_start(args, fmt);
  int n;
  static char buf[MAXLEN]; 

  if (NULL == gzgets(stream, buf, MAXLEN)) {
    printf("gzscanf: Failed to read line from gz file.\n");
    exit(EXIT_FAILURE);
  }
  n = vsscanf(buf, fmt, args);
  va_end(args);
  return n;
}

zlib を使用できますが、I / O呼び出しを置き換えてzlibにする必要があります。固有。

これを行うにはパイプを開く必要があります。擬似コードの基本的なフローは次のとおりです。

create pipe // man pipe

fork // man fork

if (parent) {
    close the writing end of the pipe // man 2 close
    read from the pipe // man 2 read
} else if (child) {
    close the reading end of the pipe // man 2 close
    overwrite the file descriptor for stdout with the writing end of the pipe // man dup2 
    call exec() with gzip and the relevant parameters // man 3 exec
}

これを行う方法の詳細については、コメントの man ページを使用できます。

zlibを使用して、通常のファイルポインターにラップすることができます。これにより、fscanf、freadなどを使用できます。透過的に。

FILE *myfopen(const char *path, const char *mode)
{
#ifdef WITH_ZLIB
  gzFile *zfp;

  /* try gzopen */
  zfp = gzopen(path,mode);
  if (zfp == NULL)
    return fopen(path,mode);

  /* open file pointer */
  return funopen(zfp,
                 (int(*)(void*,char*,int))gzread,
                 (int(*)(void*,const char*,int))gzwrite,
                 (fpos_t(*)(void*,fpos_t,int))gzseek,
                 (int(*)(void*))gzclose);
#else
  return fopen(path,mode);
#endif
}

zlib を使用して .gz ファイルを開くのは非常に簡単です。 zlib.net に合理的なマニュアルがあります。

開始するための簡単な例を次に示します。

#include <stdio.h>
#include <zlib.h>

int main( int argc, char **argv )
{
    // we're reading 2 text lines, and a binary blob from the given file
    char line1[1024];
    char line2[1024];
    int  blob[64];

    if (argc > 1)
    {
        const char *filename = argv[1];
        gzFile gz_in = gzopen( filename, "rb" );  // same as fopen()

        if (gz_in != NULL)
        {
            if ( gzgets( gz_in, line1, sizeof(line1) ) != NULL )  // same as fgets()
            {
                if ( gzgets( gz_in, line2, sizeof(line2) ) != NULL )
                {
                    if ( gzfread( blob, sizeof(int), 64, gz_in ) == 64 )  // same as fread()
                    {
                        printf("Line1: %s", line1);
                        printf("Line2: %s", line2);
                        // ...etc
                    }
                }
            }
            gzclose(gz_in);  // same as fclose()
        }
        else
        {
            printf( "Failed to GZ-open [%s]\n", filename );
        }
    }
    return 0;
}

UNIXの gcc ... -lz

で zlib とリンクすることを忘れないでください
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