XTSオブジェクトを作成すると、タイムスタンプが変更されます
https://stackoverflow.com/questions/7341857
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27-10-2019 - |
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私が持っているとしましょう：
R> str(data)
'data.frame': 4 obs. of 2 variables:
$ datetime: Factor w/ 4 levels "2011-01-05 09:30:00.001",..: 1 2 3 4
$ price : num 18.3 18.3 18.3 18.3
R> data
datetime price
1 2011-01-05 09:30:00.001 18.31
2 2011-01-05 09:30:00.321 18.33
3 2011-01-05 09:30:01.511 18.33
4 2011-01-05 09:30:02.192 18.34
これをanにロードしようとするとき xts オブジェクトタイムスタンプが微妙に変更されます：
R> x <- xts(data[-1], as.POSIXct(strptime(data$datetime, '%Y-%m-%d %H:%M:%OS')))
R> str(x)
An ‘xts’ object from 2011-01-05 09:30:00.000 to 2011-01-05 09:30:02.191 containing:
Data: num [1:4, 1] 18.3 18.3 18.3 18.3
- attr(*, "dimnames")=List of 2
..$ : NULL
..$ : chr "price"
Indexed by objects of class: [POSIXct,POSIXt] TZ:
xts Attributes:
NULL
R> x
price
2011-01-05 09:30:00.000 18.31
2011-01-05 09:30:00.321 18.33
2011-01-05 09:30:01.510 18.33
2011-01-05 09:30:02.191 18.34
タイムスタンプが変更されたことに気付くでしょう。最初のエントリは現在発生します 09:30:00.000 元のデータが言ったことの代わりに、 09:30:00.001. 。 3行目と4行も間違っています。
何が原因ですか？私は根本的に間違ったことをしていますか？私はさまざまな呪文を試して、データをに取得しました xts オブジェクトとそれらはすべてこの動作を示しているようです。
編集： 追加 sessionInfo()
R> sessionInfo()
R version 2.13.1 (2011-07-08)
Platform: x86_64-unknown-linux-gnu (64-bit)
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_US.UTF-8
[4] LC_COLLATE=C LC_MONETARY=C LC_MESSAGES=en_US.UTF-8
[7] LC_PAPER=en_US.UTF-8 LC_NAME=C LC_ADDRESS=C
[10] LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] xts_0.8-2 zoo_1.7-4
loaded via a namespace (and not attached):
[1] grid_2.13.1 lattice_0.19-30 tools_2.13.1
編集2： ソースデータを次のようにマイクロ秒の精度に変更する場合：
datetime,price
2011-01-05 09:30:00.001000,18.31
2011-01-05 09:30:00.321000,18.33
2011-01-05 09:30:01.511000,18.33
2011-01-05 09:30:02.192000,18.34
そして、私が持っているようにそれをロードします：
R> test
datetime price
1 2011-01-05 09:30:00.001000 18.31
2 2011-01-05 09:30:00.321000 18.33
3 2011-01-05 09:30:01.511000 18.33
4 2011-01-05 09:30:02.192000 18.34
そして、最後に、それをanに変換します xts オブジェクトとインデックス形式を設定します。
R> x <- xts(test[,-1], as.POSIXct(strptime(test$datetime, '%Y-%m-%d %H:%M:%OS')))
R> indexFormat(x) <- '%Y-%m-%d %H:%M:%OS6'
R> x
[,1]
2011-01-05 09:30:00.000999 18.31
2011-01-05 09:30:00.321000 18.33
2011-01-05 09:30:01.510999 18.33
2011-01-05 09:30:02.191999 18.34
あなたも効果を見ることができます。余分な精度を追加することが役立つことを望んでいましたが、残念ながらそうではありません。
編集3： 参照してください @Dwinの答え この動作を再現するエンドツーエンドのテストケースの場合。
編集4： 動作はミリ秒指向ではないようです。以下は、マイクロ秒解像度のタイムスタンプの同じ変更結果を示しています。入力データを変更した場合：
R> data
datetime price
1 2011-01-05 09:30:00.001001 18.31
2 2011-01-05 09:30:00.321001 18.33
3 2011-01-05 09:30:01.511001 18.33
4 2011-01-05 09:30:02.192005 18.34
そして、作成します xts 物体：
R> x <- xts(data[-1],
as.POSIXct(strptime(as.character(data$datetime), '%Y-%m-%d %H:%M:%OS')))
R> indexFormat(x) <- '%Y-%m-%d %H:%M:%OS6'
R> x
price
2011-01-05 09:30:00.001000 18.31
2011-01-05 09:30:00.321001 18.33
2011-01-05 09:30:01.511001 18.33
2011-01-05 09:30:02.192004 18.34
編集5： それは浮動小数点精密な問題のように見えます。観察：
R> t <- as.POSIXct("2011-01-05 09:30:00.001001")
R> t
[1] "2011-01-05 09:30:00.001 CST"
R> as.numeric(t)
[1] 1294241400.0010008812
これはエラーの動作を示し、編集4の例と一致しています。ただし、エラーが表示されなかった例を使用して：
R> t <- as.POSIXct("2011-01-05 09:30:01.511001")
R> t
[1] "2011-01-05 09:30:01.511001 CST"
R> as.numeric(t)
[1] 1294241401.5110011101
まるでそうです xts または、基礎となるコンポーネントが最も近いものではなく丸くなっていますか？
解決
問題は印刷にのみあるようです。 OPのオリジナルを使用します data:
ind <- as.POSIXct(strptime(data$datetime, '%Y-%m-%d %H:%M:%OS'))
as.numeric(ind)*1e6 # as expected
# [1] 1294241400001000 1294241400321000 1294241401511000 1294241402192000
ind # wrong
# [1] "2011-01-05 09:30:00.000 CST" "2011-01-05 09:30:00.321 CST"
# [3] "2011-01-05 09:30:01.510 CST" "2011-01-05 09:30:02.191 CST"
x <- xts(data[-1], ind)
x # wrong
# price
# 2011-01-05 09:30:00.000 18.31
# 2011-01-05 09:30:00.321 18.33
# 2011-01-05 09:30:01.510 18.33
# 2011-01-05 09:30:02.191 18.34
as.numeric(index(x))*1e6 # but the underlying index values are as expected
# [1] 1294241400001000 1294241400321000 1294241401511000 1294241402192000
他のヒント
あなたはあなたの時間を要因にしています：
R> str(data)
'data.frame': 4 obs. of 2 variables:
$ datetime: Factor w/ 4 levels "2011-01-05 09:30:00.001",..: 1 2 3 4
[...]
それは始めるのに最適な場所ではありません。キャラクターに変換する必要があります。したがって、の代わりに
x <- xts(data[-1], as.POSIXct(strptime(data$datetime, '%Y-%m-%d %H:%M:%OS')))
提案します
x <- xts(data[-1],
order.by=as.POSIXct(strptime(as.character(data$datetime),
'%Y-%m-%d %H:%M:%OS')))
私の経験では、 as.character() 要因の周りは重要です。要因はモデリングに強力ですが、データの読み取りから誤って取得すると、それらは少し迷惑です。使用する stringsAsFactor=FALSE あなたの利益のために、データのインポートでそれらを避けてください。
編集： したがって、これはStrptime/Strftimeの実装を示しているようです。問題をより面白くするために、Rはこれらのいくつかをオペレーティングシステムから取得し、 src/main/datetime.c.
また、最小に注意してください イプシロン 時間変数に追加できますが、それでもrを等しいと見なすことができます。私の64ビットLinuxシステムでは、これは10^-7：
R> sapply(seq(1, 8), FUN=function(x) identical(now, now+1/10^x))
[1] FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE FALSE TRUE TRUE
R>
私はこれを投稿して、それを探求したい人が、OPのシステム以上のもので起こることを示す再現可能な例を持つことができるように投稿します。 as.character 要因には、それが発生しないようにします。
dat <- read.table(textConnection(" datetime\tprice
1\t2011-01-05 09:30:00.001\t18.31
2\t2011-01-05 09:30:00.321\t18.33
3\t2011-01-05 09:30:01.511\t18.33
4\t2011-01-05 09:30:02.192\t18.34"), header =TRUE, sep="\t")
as.character(dat$datetime)
#[1] "2011-01-05 09:30:00.001" "2011-01-05 09:30:00.321" "2011-01-05 09:30:01.511"
#[4] "2011-01-05 09:30:02.192"
strptime(as.character(dat$datetime), '%Y-%m-%d %H:%M:%OS')
#[1] "2011-01-05 09:30:00" "2011-01-05 09:30:00" "2011-01-05 09:30:01"
#[4] "2011-01-05 09:30:02"
as.POSIXct(strptime(as.character(dat$datetime),
'%Y-%m-%d %H:%M:%OS'))
#[1] "2011-01-05 09:30:00 EST" "2011-01-05 09:30:00 EST" "2011-01-05 09:30:01 EST"
#[4] "2011-01-05 09:30:02 EST"
x <- xts(dat[-1],
order.by=as.POSIXct(strptime(as.character(dat$datetime),
'%Y-%m-%d %H:%M:%OS')))
x
#### price
2011-01-05 09:30:00 18.31
2011-01-05 09:30:00 18.33
2011-01-05 09:30:01 18.33
2011-01-05 09:30:02 18.34
indexFormat(x) <- '%Y-%m-%d %H:%M:%OS6'
x
price
2011-01-05 09:30:00.000999 18.31
2011-01-05 09:30:00.321000 18.33
2011-01-05 09:30:01.510999 18.33
2011-01-05 09:30:02.191999 18.34
sessionInfo()
R version 2.13.1 RC (2011-07-03 r56263)
Platform: x86_64-apple-darwin9.8.0/x86_64 (64-bit)
locale:
[1] en_US.UTF-8/en_US.UTF-8/C/C/en_US.UTF-8/en_US.UTF-8
attached base packages:
[1] grid splines stats graphics grDevices utils datasets methods
[9] base
other attached packages:
[1] xts_0.8-2 zoo_1.7-4 sculpt3d_0.2-2 RGtk2_2.20.12
[5] rgl_0.92.798 survey_3.24 hexbin_1.26.0 spam_0.23-0
[9] xtable_1.5-6 polspline_1.1.5 Ryacas_0.2-10 XML_3.4-0
[13] rms_3.3-1 Hmisc_3.8-3 survival_2.36-9 sos_1.3-0
[17] brew_1.0-6 lattice_0.19-30
loaded via a namespace (and not attached):
[1] cluster_1.14.0 tools_2.13.1
所属していません StackOverflow
