キャレット::列車 - 値が代入されていません

Question

キャレットの列車（）メソッドの前処理引数に「KNNIMPUTE」を渡して値を差し引いています。次の例に基づいて、値が帰属しないように見え、その後無視されます。私は何を間違っていますか？

あらゆる助けが大いに評価されています。

library("caret")

set.seed(1234)
data(iris)

# mark 8 of the cells as NA, so they can be imputed
row <- sample (1:nrow (iris), 8)
iris [row, 1] <- NA

# split test vs training
train.index <- createDataPartition (y = iris[,5], p = 0.80, list = F)
train <- iris [ train.index, ]
test  <- iris [-train.index, ]

# train the model after imputing the missing data
fit <- train (Species ~ ., 
              train, 
              preProcess = c("knnImpute"), 
              na.action  = na.pass, 
              method     = "rpart" )
test$species.hat <- predict (fit, test)

# there is 1 obs. (of 30) in the test set equal to NA  
# this 1 obs. was not returned from predict
Error in `$<-.data.frame`(`*tmp*`, "species.hat", value = c(1L, 1L, 1L,  : 
  replacement has 29 rows, data has 30

.

更新：プリプロセス関数を直接使用して値を差し引くことができました。私はまだこれが列車機能内で発生していないような理由がわからない。

# attempt to impute using nearest neighbors
x <- iris [, 1:4]
pp <- preProcess (x, method = c("knnImpute"))
x.imputed <- predict (pp, newdata = x)

# expect all NAs were populated with an imputed value
stopifnot( all (!is.na (x.imputed)))
stopifnot( length (x) == length (x.imputed))

.

Answer 1

?predict.train：

 ## S3 method for class 'train'
 predict(object, newdata = NULL, type = "raw", na.action = na.omit, ...)

.

ここではna.omitがあります：

 > length(predict (fit, test))
 [1] 29
 > length(predict (fit, test, na.action = na.pass))
 [1] 30

.

max