Como excluir colunas em numpy.array

Question

Eu gostaria de apagar colunas selecionadas em um numpy.array. Isto é o que eu faço:

n [397]: a = array([[ NaN,   2.,   3., NaN],
   .....:        [  1.,   2.,   3., 9]])

In [398]: print a
[[ NaN   2.   3.  NaN]
 [  1.   2.   3.   9.]]

In [399]: z = any(isnan(a), axis=0)

In [400]: print z
[ True False False  True]

In [401]: delete(a, z, axis = 1)
Out[401]:
 array([[  3.,  NaN],
       [  3.,   9.]])

Neste exemplo, o meu objetivo é eliminar todas as colunas que contêm NaN de. Espero que o último comando para resultar em:

array([[2., 3.],
       [2., 3.]])

Como posso fazer isso?

Answer 1

Dado o seu nome, acho que a forma padrão deve ser delete:

import numpy as np

A = np.delete(A, 1, 0)  # delete second row of A
B = np.delete(B, 2, 0)  # delete third row of B
C = np.delete(C, 1, 1)  # delete second column of C

De acordo com a página de documentação de numpy , os parâmetros para numpy.delete são as seguintes:

numpy.delete(arr, obj, axis=None)

• arr refere-se à matriz de entrada,
• obj refere-se a que sub-matrizes (por exemplo, coluna / linha n. Ou fatia da matriz) e
• axis refere-se a coluna sábio (axis = 1) ou linha a linha (axis = 0) operação de apagamento.

Answer 2

Exemplo de a documentação numpy :

>>> a = numpy.array([[ 0,  1,  2,  3],
               [ 4,  5,  6,  7],
               [ 8,  9, 10, 11],
               [12, 13, 14, 15]])

>>> numpy.delete(a, numpy.s_[1:3], axis=0)                       # remove rows 1 and 2

array([[ 0,  1,  2,  3],
       [12, 13, 14, 15]])

>>> numpy.delete(a, numpy.s_[1:3], axis=1)                       # remove columns 1 and 2

array([[ 0,  3],
       [ 4,  7],
       [ 8, 11],
       [12, 15]])

Answer 3

Outra maneira é usar matrizes mascarados:

import numpy as np
a = np.array([[ np.nan,   2.,   3., np.nan], [  1.,   2.,   3., 9]])
print(a)
# [[ NaN   2.   3.  NaN]
#  [  1.   2.   3.   9.]]

O método np.ma.masked_invalid retorna uma matriz mascarado com nans e infs mascaradas:

print(np.ma.masked_invalid(a))
[[-- 2.0 3.0 --]
 [1.0 2.0 3.0 9.0]]

O método np.ma.compress_cols retorna uma matriz 2-D com qualquer uma coluna que continha valor mascarado suprimida:

a=np.ma.compress_cols(np.ma.masked_invalid(a))
print(a)
# [[ 2.  3.]
#  [ 2.  3.]]

Veja manipulando-a-maskedarray

Answer 4

Isso cria um outro array sem essas colunas:

  b = a.compress(logical_not(z), axis=1)

Answer 5

A partir Documentação Numpy

np.delete (arr, obj, eixo = Nenhum) Retornar uma nova matriz com sub-matrizes ao longo de um eixo suprimido.

>>> arr
array([[ 1,  2,  3,  4],
       [ 5,  6,  7,  8],
       [ 9, 10, 11, 12]])
>>> np.delete(arr, 1, 0)
array([[ 1,  2,  3,  4],
       [ 9, 10, 11, 12]])

>>> np.delete(arr, np.s_[::2], 1)
array([[ 2,  4],
       [ 6,  8],
       [10, 12]])
>>> np.delete(arr, [1,3,5], None)
array([ 1,  3,  5,  7,  8,  9, 10, 11, 12])

Answer 6

Na sua situação, você pode extrair os dados desejados com:

a[:, -z]

"- z" é a negação lógica da matriz booleana "z". Este é o mesmo que:

a[:, logical_not(z)]

Answer 7

>>> A = array([[ 1,  2,  3,  4],
               [ 5,  6,  7,  8],
               [ 9, 10, 11, 12]])

>>> A = A.transpose()

>>> A = A[1:].transpose()

Answer 8

removendo colunas de matriz que contêm NaN. Esta é uma resposta longa, mas espero fácil de seguir.

def column_to_vector(matrix, i):
    return [row[i] for row in matrix]
import numpy
def remove_NaN_columns(matrix):
    import scipy
    import math
    from numpy import column_stack, vstack

    columns = A.shape[1]
    #print("columns", columns)
    result = []
    skip_column = True
    for column in range(0, columns):
        vector = column_to_vector(A, column)
        skip_column = False
        for value in vector:
            # print(column, vector, value, math.isnan(value) )
            if math.isnan(value):
                skip_column = True
        if skip_column == False:
            result.append(vector)
    return column_stack(result)

### test it
A = vstack(([ float('NaN'), 2., 3., float('NaN')], [ 1., 2., 3., 9]))
print("A shape", A.shape, "\n", A)
B = remove_NaN_columns(A)
print("B shape", B.shape, "\n", B)

A shape (2, 4) 
 [[ nan   2.   3.  nan]
 [  1.   2.   3.   9.]]
B shape (2, 2) 
 [[ 2.  3.]
 [ 2.  3.]]