Por que o eixo x do meu gráfico começa em 5 em vez de no ponto mais baixo do vetor?

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  •  29-10-2019
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Pergunta

Estou tentando fazer um histograma de um vetor usando R. Quando ploto isso, o eixo x vai de 5 a 9, mas parte do histograma é anterior a 5 (o menor número é 4,414002) e parte dele édepois de 9. O mesmo vale para meu eixo y, vai de 0-5000, mas o 'stave' de altura vai um pouco acima de 5000.

Por que não começa no valor mais baixo do vetor?Lembre-se, é apenas a barra que não é longa o suficiente, o gráfico é do tamanho certo (então não é um problema com as configurações mar ou oma, tentei alterá-las, mas não ajudou)

Abaixo está o meu código

import rpy2.robjects as R
import R_functions as R_funct


csvData = (R.r['read.csv'](file='/homes/ndeklein/test.csv', head=True, sep='\t'))

hist = R.r.hist
R.r.png('/homes/ndeklein/test_intensity_hist.png', width=300, height=300)
intensityVector = csvData[0]
logIntensityVector = R.r['log10'](intensityVector)

hist(logIntensityVector, main='Intensity per feature histogram', xlab='logged intensity', ylab='frequencies of features', br=20)

R.r['dev.off']()

Editar:

Eu descobri qual é o problema e no código R ele ficaria assim:

vector = c(5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 5.67750749154535, 6.7399637450174, 6.7399637450174, 6.7399637450174, 6.7399637450174, 6.7399637450174, 6.7399637450174, 6.7399637450174, 6.7399637450174)
hist(vector, breaks=20)

Mas como o intervalo está entre 4-9 (bem, menos neste exemplo), ter 20 quebras é demais.Colocar as pausas no 6 resolve o problema.

Foi útil?

Solução

Colocando as quebras em um número inferior (br= 6 no meu exemplo)

hist(logIntensityVector, main='Intensity per feature histogram', xlab='logged intensity', ylab='frequencies of features', br=6)

resolveu o problema.

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