R 2.15.1;Rhipe 0.73;CDH 5 - java.io.IOException:Nenhum sistema de arquivos para o esquema:o hdfs

Question

Eu tinha instalado CDH5 no Debian 7.Eu trabalho do Hadoop com MapReduce1 em um Único Nó de Pseudo-Modo distribuído.

Eu gostaria de executar Rhipe dentro de R.Depois de baixar eu tinha instalado:

sudo R CMD INSTALL Rhipe_0.73.1.tar.gz

Então eu exportados variáveis de ambiente:

export HADOOP_CONF_DIR="/etc/hadoop/conf"
export HADOOP="/usr/lib/hadoop"
export HADOOP_BIN=/usr/lib/hadoop/bin
export HADOOP_HOME=/usr/lib/hadoop

Após a execução de R:

> library(Rhipe)
------------------------------------------------
| Please call rhinit() else RHIPE will not run |
------------------------------------------------
> rhinit()
Rhipe: Using Rhipe.jar file
Initializing Rhipe v0.73
14/04/11 12:21:08 WARN util.NativeCodeLoader: Unable to load native-hadoop library for your platform... using builtin-java classes where applicable
java.io.IOException: No FileSystem for scheme: hdfs
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem.getFileSystemClass(FileSystem.java:2385)
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem.createFileSystem(FileSystem.java:2392)
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem.access$200(FileSystem.java:89)
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem$Cache.getInternal(FileSystem.java:2431)
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem$Cache.get(FileSystem.java:2413)
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem.get(FileSystem.java:368)
    at org.apache.hadoop.fs.FileSystem.get(FileSystem.java:167)
    at org.godhuli.rhipe.PersonalServer.run(PersonalServer.java:321)
    at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method)
    at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl.java:57)
    at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAccessorImpl.java:43)
    at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:616)
    at RJavaTools.invokeMethod(RJavaTools.java:386)
Error in .jcall("RJavaTools", "Ljava/lang/Object;", "invokeMethod", cl,  : 
  java.lang.NullPointerException
> 

Eu estou faltando alguma coisa?

Java utilizada no sistema:

There are 2 choices for the alternative java (providing /usr/bin/java).

  Selection    Path                                            Priority   Status
------------------------------------------------------------
  0            /usr/lib/jvm/java-6-openjdk-amd64/jre/bin/java   1061      auto mode
* 1            /usr/lib/jvm/j2sdk1.7-oracle/jre/bin/java        317       manual mode
  2            /usr/lib/jvm/java-6-openjdk-amd64/jre/bin/java   1061      manual mode

Answer 1

O rhinit() função é tentar carregar o hadoop frascos que estão presentes no diretório especificado na HADOOP_HOME variável.Desde que esta função só carregar os frascos em HADOOP_HOME para o caminho de classe, você tem que manter todos os hadoop específicos frascos em que o próprio diretório.

Você pode entender isso se você olhar para zzz.R arquivo em rhipe pacote.