Posso aplicar uma PMML modelo que inclui DefineFunction usando Augusto (Python)?

Question

Eu estou usando Augusto como um modelo PMML consumidor.Modifiquei o adicionar dois números de exemplo para incluir um DefineFunction elemento, como esta:

<PMML version="4.1" xmlns="http://www.dmg.org/PMML-4_1">
    <Header/>
    <DataDictionary>
        <DataField name="x" dataType="double" optype="continuous"/>
        <DataField name="y" dataType="double" optype="continuous"/>
    </DataDictionary>
    <TransformationDictionary>
        <DefineFunction dataType="float" optype="continuous" name="add">
            <ParameterField optype="continuous" name="first"></ParameterField>
            <ParameterField optype="continuous" name="second"></ParameterField>
                <Apply function="+" invalidValueTreatment="returnInvalid">
                    <FieldRef field="first"></FieldRef>
                    <FieldRef field="second"></FieldRef>
                </Apply>
        </DefineFunction>
        <DerivedField name="z" dataType="double" optype="continuous">
            <Apply function="add">
                <FieldRef field="x"/>
                <FieldRef field="y"/>
            </Apply>
        </DerivedField>
    </TransformationDictionary>
</PMML>

Eu salvar este modelo em um arquivo e tente executá-lo assim:

from resources import add_two_numbers_file # this is just the path to my model file
from augustus.strict import modelLoader

# Load model
with open(add_two_numbers_file, 'r') as model_file:
    model_str = model_file.read()
    model = modelLoader.loadXml(model_str)

# Run model
print model.calc({'x':[1,2,3],'y':[4,5,6]}).look()

No entanto, eu recebo um erro:

AttributeError: 'DefineFunction' object has no attribute '_setupCalculate'

Eu estou usando a mais recente tronco (revisão 794) e sou capaz de executar não modificado exemplo (sem DefineFunction) sem um problema.É DefineFunction suportado por Augusto?

Answer 1

jcrudy, você está certo:isso foi um erro.(Uma API alterado e DefineFunction não foi trazido up-to-date.) Já está corrigido no público repositório SVN:com Augusto >= r795, você pode executar o seu exemplo, como estava previsto inicialmente.

Pelo caminho, o seu PMML é proveniente de um arquivo externo, mas você carregar-lo em uma seqüência de caracteres e, em seguida, em um PMML DOM.Você pode pular o passo intermediário por que passam apenas loadXML o nome de arquivo:

model = modelLoader.loadXml(add_two_numbers_file)

(Isso pode ser relevante para grandes PMML arquivos;observe também que eles podem ser Compactado.)

Answer 2

Eu era capaz de resolver isso, fazer duas alterações.Depois de ter um olhar para o augustus de origem e a determinação de que, de fato, _setupCalculate não está definido em qualquer lugar, eu monkey patch-lo.Meu script agora este aspecto:

# Monkey-patch augustus
import augustus.pmml.DefineFunction
def _setupCalculate(self, dataTable, functionTable, performanceTable):
    return (dataTable, functionTable, performanceTable)
augustus.pmml.DefineFunction.DefineFunction._setupCalculate = _setupCalculate

# Now the actual script
from augustus.strict import modelLoader

# Load model
add_two_numbers_file = 'addTwoNumbers.pmml'
with open(add_two_numbers_file, 'r') as model_file:
    model_str = model_file.read()
    model = modelLoader.loadXml(model_str)

# Run model
print model.calc({'x':[1,2,3],'y':[4,5,6]}).look()

Eu fiz a ingênua suposição de que _setupCalculate não precisa fazer nada de importante.Eu estava agora recebendo uma diferente e mais difíceis de erro:

ValueError: assignment destination is read-only

na linha de

mask[mask2] = defs.MISSING

no FieldType.py.Depois de algumas viagens através do depurador, eu vi que essa linha foi executada apenas durante a conversão de tipo e percebi que eu estava usando tanto float e double tipos no meu PMML.Removendo desnecessários atributos de tipo de dados, eu era capaz de conseguir o seguinte para trabalhar:

<PMML version="4.1" xmlns="http://www.dmg.org/PMML-4_1">
    <Header/>
    <DataDictionary>
        <DataField name="x" dataType="double" optype="continuous"/>
        <DataField name="y" dataType="double" optype="continuous"/>
    </DataDictionary>
    <TransformationDictionary>
        <DefineFunction optype="continuous" name="add">
            <ParameterField optype="continuous" name="first"></ParameterField>
            <ParameterField optype="continuous" name="second"></ParameterField>
            <Apply function="+" invalidValueTreatment="returnInvalid">
                <FieldRef field="first"></FieldRef>
                <FieldRef field="second"></FieldRef>
            </Apply>
        </DefineFunction>
        <DerivedField name="z" dataType="double" optype="continuous">
            <Apply function="add">
                <FieldRef field="x"/>
                <FieldRef field="y"/>
            </Apply>
        </DerivedField>
    </TransformationDictionary>
</PMML>

O tronco versão de augusto, eu usei é equivalente a versão 0.6-beta3.Parece que os problemas que eu tive são apenas erros, e os truques utilizados nesta resposta são susceptíveis de se tornarem desnecessários em um futuro próximo.