Просто мыши на предмет и переместите его. Уровень файла или папки также может быть изменен таким образом. Вы можете сделать папки из Menubar: File: New: Group ".
Я вижу, что вы используете ссылки на папки, а не группы. Если нет конкретной причины для использования ссылок на папки, то измените использование групп. При перетаскивании в папке файлов есть вариант ссылок или групп папок. Поскольку ссылки на папки являются зеркалом структуры каталога и не могут быть изменены в XCODE. Я подозреваю, что ОП действительно хочет группы.
Когда вы находитесь на самом дне, вы можете перетащить горизонтально, чтобы выбрать уровень для перемещения. Смотрите добавленное изображение.