Как запустить «точку» как команду Python?

StackOverflow https://stackoverflow.com/questions/955504

Вопрос

Я использую Python на Mac OSX Leopard.

Я пытаюсь запустить программу «точка» (часть Graphviz) из Python:

# -*- coding: utf-8 -*-
import os

print os.environ['PATH']
print os.system("ls >> a.txt")
print os.system("dot -o9.png -Tpng ./6.dot")

Команда «ls» нужна только для того, чтобы убедиться, что Python находится в правильном каталоге.Это.Результат, который я получаю:

/usr/bin:/bin:/usr/sbin:/sbin 0 32512

Насколько я понимаю, ошибка 32512 означает, что Python не смог найти файл, и поскольку файл 6.dot существует (если я запускаю «dot -o9.png -Tpng ./6.dot» с терминала, я не получаю никакой ошибки, и создается 9.png), я предполагаю, что Python не может найти точечный файл.

Вероятно, мне нужно добавить точечный файл в путь.Но я не знаю, где это.Если я бегу: 

whereis dot

Я не получаю ответа.

Как я могу найти исполняемый файл точки?
Альтернативно, могу ли я запустить точечную программу как команду изнутри Python?

Это было полезно?

Решение

Вам следует изменить строку PATH, чтобы она включала каталог, содержащий dot.Этот каталог /usr/local/bin, без /dot.

Другие советы

whereis находит справочные страницы, which находит двоичные файлы.Поэтому постарайтесь which dot.

Вам нужно добавить путь к исполняемому файлу «точка» в среде Python.Вы можете сделать это, изменив переменную PATH в os.environ.

Попробуй это: 

# -*- coding: utf-8 -*-
import os
import sys

print os.environ['PATH']

os.environ['PATH'] += ":"+"/usr/local/bin"
print os.environ['PATH']

print os.getcwd()

from subprocess import check_call
print check_call(["dot", "-o9.png", "-Tpng", "./6.dot"])

Взято из вопроса, чтобы попытаться сохранить здесь какое-то здравомыслие.

Советы по устранению неполадок:

А.добавлять

print os.getcwd()

в строке перед os.system("точка и т.д.

Просто чтобы убедиться, что текущий каталог — это тот, в котором находится 6.dot файл.

Б.Убедитесь, что dot программа находится на вашем пути.

which dot

С.Используйте полный путь к dot в вашей команде os.system, посмотрите, что произойдет потом.

Если вы также создаете файлы Dot на Python, пидот делает то, что вы хотите, более Pythonic:

import pydot
dot = pydot.Dot()
n1, n2 = pydot.Node("a"), pydot.Node("b")
dot.add_node(n1)
dot.add_node(n2)
dot.add_edge(pydot.Edge(n1,n2))
dot.write_png("graph.png", prog='neato')

Часто решение находится перед нами,

print os.system("/usr/local/bin/dot -o9.png -Tpng 6.dot")

Также вы можете попробовать все точки в указанной папке.

import glob
for filedot in glob.glob('*.dot')
    print os.system("/usr/local/bin/dot -o9.png -Tpng %(filedot)s"%locals())
    #print os.system("/usr/local/bin/dot -o9.png -Tpng %s"%filedot)

Редактировать:

Я не могу вспомнить, кстати, если это так 

/usr/local/bin/dot -o9.png -Tpng fdot.dot

или

/usr/local/bin/dot -o 9.png -Tpng fdot.dot

Два предложения

  1. Не используйте PATH, вместо этого используйте «который», чтобы просто найти исполняемый файл.
  2. Вы не используете ";" (полуколон) для разделения путей, но ":" (толстой кишки).Как только вы измените это, он сможет найти вашу точечную программу.

Изменить это

os.environ['PATH'] += ";"+"/usr/local/bin/dot"

к этому

os.environ['PATH'] += ":"+"/usr/local/bin"

Тогда все в порядке.

РЕДАКТИРОВАТЬ:Обратите внимание, что я сам забыл удалить /точку из переменной PATH (упс) — PATH — это список каталогов, разделенный двоеточиями.

Вместо:

print os.system("dot -o9.png -Tpng ./6.dot")

попробуй это:

from subprocess import check_call
print check_call("dot -o9.png -Tpng ./6.dot")

Если статус выхода точечной программы равен 0, статус выводится на печать.Если точка возвращает ненулевой статус, она вызывает CalledProcessError (и показывает возвращенный статус).Если точка не существует в текущем пути, возникает OSError в Linux или WindowsErroor в Windows (я не знаю, какое исключение возникает в Mac OS, но я предполагаю, что OSError).

РЕДАКТИРОВАТЬ:Код выше даст вам подсказку, если у вас нет исполняемого файла с точкой или файла 6.dot в текущих настройках пути.

check_call не использует тот же синтаксис, что и os.system, поэтому попробуйте изменить соответствующую строку следующим образом:

print check_call(["dot", "-o9.png", "-Tpng", "./6.dot"])

Имя исполняемого файла — это первый элемент массива, и каждый параметр должен находиться в другом элементе массива.В противном случае вы будете всегда получите ошибку «Нет такого файла», поскольку в вашем PATH нет исполняемого файла с именем «dot -o9.png ...».

Одна проблема в этой строке:

os.environ['PATH'] += ":"+"/usr/local/bin/dot"

В пути вы указываете не имя исполняемого файла, а каталог, содержащий исполняемый файл.Итак, это должно быть:

os.environ['PATH'] += ":"+"/usr/local/bin"

И, как указано в другом комментарии, аргументы в пользу check_call не то же самое, что os.system.

Если вы используете графический интерфейс, например Spyder то вы можете просто добавить правильный путь к контейнеру в PYTHONPATH manager меню опций.

Найдите местоположение скрипта, выполнив это в терминале:

which programname

затем возьмите это место (где бы оно ни было), вычтите имя программы, например:

/home/username/seiscomp3/bin/scart
#this is the section of the path that you use
/home/username/seiscomp3/bin

Затем зайдите в PYTHONPATH manager меню параметров и добавьте этот путь.Затем перезапустите Spyder, и все заработает.

Лицензировано под: CC-BY-SA с атрибуция
Не связан с StackOverflow
scroll top