GraphViz - Как соединить подграфы?

Question

В DOT язык для GraphViz, Я пытаюсь представить диаграмму зависимостей.Мне нужно иметь возможность размещать узлы внутри контейнера и иметь возможность делать узлы и / или контейнеры зависимыми от других узлов и / или контейнеров.

Я использую subgraph чтобы представлять мои контейнеры.Связывание узлов работает просто отлично, но я не могу понять, как соединить подграфы.

Учитывая приведенную ниже программу, мне нужно иметь возможность подключиться cluster_1 и cluster_2 со стрелкой, но все, что я пробовал, создает новые узлы вместо соединения кластеров:

digraph G {

    graph [fontsize=10 fontname="Verdana"];
    node [shape=record fontsize=10 fontname="Verdana"];

    subgraph cluster_0 {
        node [style=filled];
        "Item 1" "Item 2";
        label = "Container A";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_1 {
        node [style=filled];
        "Item 3" "Item 4";
        label = "Container B";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_2 {
        node [style=filled];
        "Item 5" "Item 6";
        label = "Container C";
        color=blue;
    }

    // Renders fine
    "Item 1" -> "Item 2";
    "Item 2" -> "Item 3";

    // Both of these create new nodes
    cluster_1 -> cluster_2;
    "Container A" -> "Container C";
}

Answer 1

В руководстве пользователя DOT приведен следующий пример графа с кластерами с ребрами между кластерами.

digraph G {
  compound=true;
  subgraph cluster0 {
    a -> b;
    a -> c;
    b -> d;
    c -> d;
  }
  subgraph cluster1 {
    e -> g;
    e -> f;
  }
  b -> f [lhead=cluster1];
  d -> e;
  c -> g [ltail=cluster0,lhead=cluster1];
  c -> e [ltail=cluster0];
  d -> h;
}

и ребра между узлами и кластерами.

Answer 2

Для удобства использования решение, описанное в ответе HighPerformanceMark, примененное непосредственно к исходному вопросу, выглядит следующим образом:

digraph G {

    graph [fontsize=10 fontname="Verdana" compound=true];
    node [shape=record fontsize=10 fontname="Verdana"];

    subgraph cluster_0 {
        node [style=filled];
        "Item 1" "Item 2";
        label = "Container A";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_1 {
        node [style=filled];
        "Item 3" "Item 4";
        label = "Container B";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_2 {
        node [style=filled];
        "Item 5" "Item 6";
        label = "Container C";
        color=blue;
    }

    // Edges between nodes render fine
    "Item 1" -> "Item 2";
    "Item 2" -> "Item 3";

    // Edges that directly connect one cluster to another
    "Item 1" -> "Item 3" [ltail=cluster_0 lhead=cluster_1];
    "Item 1" -> "Item 5" [ltail=cluster_0 lhead=cluster_2];
}

Тот самый compound=true в graph декларация имеет жизненно важное значение.Это приводит к получению результата:

Обратите внимание, что я изменил ребра на ссылочные узлы внутри кластера, добавил атрибуты ltail и lhead к каждому ребру, указав имя кластера, и добавил атрибут уровня графика 'compound=true'.

Что касается беспокойства о том, что кто-то может захотеть подключить кластер без узлов внутри него, мое решение заключалось в следующем всегда добавьте узел в каждый кластер, отображаемый с помощью style=plaintext.Используйте этот узел для обозначения кластера (вместо встроенного атрибута кластера "label", который должен быть установлен в пустую строку (в Python, label='""').Это означает, что я больше не добавляю ребра, соединяющие кластеры напрямую, но это работает в моей конкретной ситуации.

Answer 3

Убедитесь, что вы используете fdp макет для файла.я не думаю neato поддерживает кластеры.