Как восстановить объекты Git, поврежденные в результате сбоя жесткого диска?

Question

У меня произошел сбой жесткого диска, в результате которого были повреждены некоторые файлы репозитория Git.При запуске git fsck --full Я получаю следующий результат:

error: .git/objects/pack/pack-6863e0a0e4b4ded6090fac5d12eba6ca7346b19c.pack SHA1 checksum mismatch
error: index CRC mismatch for object 6c8cae4994b5ec7891ccb1527d30634997a978ee from .git/objects/pack/pack-6863e0a0e4b4ded6090fac5d12eba6ca7346b19c.pack at offset 97824129
error: inflate: data stream error (invalid code lengths set)
error: cannot unpack 6c8cae4994b5ec7891ccb1527d30634997a978ee from .git/objects/pack/pack-6863e0a0e4b4ded6090fac5d12eba6ca7346b19c.pack at offset 97824129
error: inflate: data stream error (invalid stored block lengths)
error: failed to read object 0dcf6723cc69cc7f91d4a7432d0f1a1f05e77eaa at offset 276988017 from .git/objects/pack/pack-6863e0a0e4b4ded6090fac5d12eba6ca7346b19c.pack
fatal: object 0dcf6723cc69cc7f91d4a7432d0f1a1f05e77eaa is corrupted

У меня есть резервные копии репозитория, но единственная резервная копия, включающая файл pack, уже повреждена.Поэтому я думаю, что мне нужно найти способ извлекать отдельные объекты из разных резервных копий и каким-то образом проинструктировать Git создать новый пакет только с правильными объектами.

Не могли бы вы, пожалуйста, дать мне подсказки, как исправить мой репозиторий?

Answer 1

В некоторых предыдущих резервных копиях ваши поврежденные объекты, возможно, были упакованы в другие файлы или еще оставались незакрепленными объектами.Таким образом, ваши объекты могут быть восстановлены.

Похоже, в вашей базе данных есть несколько плохих объектов.Таким образом, вы могли бы сделать это вручную.

Из - за git hash-object, git mktree и git commit-tree не записывайте объекты, потому что они находятся в пакете, затем начните делать это:

mv .git/objects/pack/* <somewhere>
for i in <somewhere>/*.pack; do
  git unpack-objects -r < $i
done
rm <somewhere>/*

(Ваши пакеты будут удалены из хранилища и снова распакованы в нем;теперь в базе данных есть только хорошие объекты)

Вы можете сделать:

git cat-file -t 6c8cae4994b5ec7891ccb1527d30634997a978ee

и проверьте тип объекта.

Если тип является blob:извлеките содержимое файла из предыдущих резервных копий (с помощью git show или git cat-file или git unpack-file;тогда вы можете git hash-object -w чтобы переписать объект в вашем текущем репозитории.

Если тип - дерево:вы могли бы использовать git ls-tree чтобы восстановить дерево из предыдущих резервных копий;тогда git mktree чтобы записать его снова в ваш текущий репозиторий.

Если тип является commit:то же самое с git show, git cat-file и git commit-tree.

Конечно, я бы сделал резервную копию вашей оригинальной рабочей копии, прежде чем начинать этот процесс.

Кроме того, взгляните на Как восстановить поврежденный Blob-объект.

Answer 2

Баненгуск это наставляло меня на правильный путь.Для дополнительной справки я хочу опубликовать шаги, которые я предпринял, чтобы исправить повреждение моего репозитория.Мне посчастливилось найти все необходимые объекты либо в старых пакетах, либо в резервных копиях репозитория.

# Unpack last non-corrupted pack
$ mv .git/objects/pack .git/objects/pack.old
$ git unpack-objects -r < .git/objects/pack.old/pack-012066c998b2d171913aeb5bf0719fd4655fa7d0.pack
$ git log
fatal: bad object HEAD

$ cat .git/HEAD 
ref: refs/heads/master

$ ls .git/refs/heads/

$ cat .git/packed-refs 
# pack-refs with: peeled 
aa268a069add6d71e162c4e2455c1b690079c8c1 refs/heads/master

$ git fsck --full 
error: HEAD: invalid sha1 pointer aa268a069add6d71e162c4e2455c1b690079c8c1
error: refs/heads/master does not point to a valid object!
missing blob 75405ef0e6f66e48c1ff836786ff110efa33a919
missing blob 27c4611ffbc3c32712a395910a96052a3de67c9b
dangling tree 30473f109d87f4bcde612a2b9a204c3e322cb0dc

# Copy HEAD object from backup of repository
$ cp repobackup/.git/objects/aa/268a069add6d71e162c4e2455c1b690079c8c1 .git/objects/aa
# Now copy all missing objects from backup of repository and run "git fsck --full" afterwards
# Repeat until git fsck --full only reports dangling objects

# Now garbage collect repo
$ git gc
warning: reflog of 'HEAD' references pruned commits
warning: reflog of 'refs/heads/master' references pruned commits
Counting objects: 3992, done.
Delta compression using 2 threads.
fatal: object bf1c4953c0ea4a045bf0975a916b53d247e7ca94 inconsistent object length (6093 vs 415232)
error: failed to run repack

# Check reflogs...
$ git reflog

# ...then clean
$ git reflog expire --expire=0 --all

# Now garbage collect again
$ git gc       
Counting objects: 3992, done.
Delta compression using 2 threads.
Compressing objects: 100% (3970/3970), done.
Writing objects: 100% (3992/3992), done.
Total 3992 (delta 2060), reused 0 (delta 0)
Removing duplicate objects: 100% (256/256), done.
# Done!

Answer 3

Сначала попробуйте выполнить следующие команды (при необходимости выполните еще раз).:

$ git fsck --full
$ git gc
$ git gc --prune=today
$ git fetch --all
$ git pull --rebase

И потом, у вас все еще есть проблемы, попробуйте, может:

• удалите все поврежденные объекты, например

  fatal: loose object 91c5...51e5 (stored in .git/objects/06/91c5...51e5) is corrupt
  $ rm -v .git/objects/06/91c5...51e5
  

• удалите все пустые объекты, например

  error: object file .git/objects/06/91c5...51e5 is empty
  $ find .git/objects/ -size 0 -exec rm -vf "{}" \;
  

• проверьте сообщение "неработающая ссылка" с помощью:

  git ls-tree 2d9263c6d23595e7cb2a21e5ebbb53655278dff8
  

  Это сообщит вам, из какого файла был получен поврежденный большой двоичный объект!

• возможно, вам действительно повезет восстановить файл, и это может быть версия, которую вы уже проверили в своем рабочем дереве:

  git hash-object -w my-magic-file
  

  опять же, и если он выводит отсутствующий SHA1 (4b945 ..), теперь все готово!

• предполагая, что это была какая-то более старая версия, которая была сломана, самый простой способ сделать это - сделать:

  git log --raw --all --full-history -- subdirectory/my-magic-file
  

  и это покажет вам весь журнал для этого файла (пожалуйста, поймите, что дерево, которое у вас было, может не быть деревом верхнего уровня, поэтому вам нужно самостоятельно выяснить, в каком подкаталоге оно находилось), тогда теперь вы можете снова воссоздать отсутствующий объект с помощью hash-object .

• чтобы получить список всех ссылок с отсутствующими коммит, деревьями или большими объектами:

  $ git for-each-ref --format='%(refname)' | while read ref; do git rev-list --objects $ref >/dev/null || echo "in $ref"; done
  

  Возможно, будет невозможно удалить некоторые из этих ссылок с помощью обычных команд branch -d или tag -d, поскольку они исчезнут, если git заметит повреждение.Поэтому вместо этого используйте команду git update-ref -d $ref .Обратите внимание, что в случае локальных ветвей эта команда может оставить устаревшую конфигурацию ветви в файле .git/config.Его можно удалить вручную (найдите раздел [ветка "$ref"]).

• После того, как все ссылки будут очищены, в рефлоге все еще могут быть нарушенные коммиты.Вы можете очистить все рефлоги, используя git reflog expire --expire=now --all.Если вы не хотите потерять все свои рефлоги, вы можете выполнить поиск поврежденных рефлогов по отдельным ссылкам:

  $ (echo HEAD; git for-each-ref --format='%(refname)') | while read ref; do git rev-list -g --objects $ref >/dev/null || echo "in $ref"; done
  

  (Обратите внимание на добавленную опцию -g в git rev-list .) Затем используйте git reflog expire --expire=now $ref для каждого из них.Когда все неработающие ссылки и рефлоги исчезнут, запустите git fsck --full, чтобы проверить, что репозиторий чист.Болтающиеся предметы - это нормально.

---

Ниже вы можете ознакомиться с расширенным использованием команд, которые потенциально могут привести к потере ваших данных в вашем репозитории git, если их использовать неразумно, поэтому сделайте резервную копию, прежде чем случайно нанесете дальнейший ущерб вашему git.Попробуйте на свой страх и риск, если вы знаете, что делаете.

---

Чтобы вытащить текущую ветвь поверх вышестоящей ветви после выборки:

$ git pull --rebase

Вы также можете попробовать оформить заказ в новой ветке и удалить старую:

$ git checkout -b new_master origin/master

---

Чтобы найти поврежденный объект в git для удаления, попробуйте выполнить следующую команду:

while [ true ]; do f=`git fsck --full 2>&1|awk '{print $3}'|sed -r 's/(^..)(.*)/objects\/\1\/\2/'`; if [ ! -f "$f" ]; then break; fi; echo delete $f; rm -f "$f"; done

Для OSX используйте sed -E вместо того, чтобы sed -r.

---

Другая идея состоит в том, чтобы распаковать все объекты из файлов пакета, чтобы повторно создать все объекты внутри .git/objects, поэтому попробуйте выполнить следующие команды в вашем репозитории:

$ cp -fr .git/objects/pack .git/objects/pack.bak
$ for i in .git/objects/pack.bak/*.pack; do git unpack-objects -r < $i; done
$ rm -frv .git/objects/pack.bak

---

Если вышесказанное не помогло, вы можете попробовать выполнить rsync или скопировать объекты git из другого репозитория, например

$ rsync -varu git_server:/path/to/git/.git local_git_repo/
$ rsync -varu /local/path/to/other-working/git/.git local_git_repo/
$ cp -frv ../other_repo/.git/objects .git/objects

---

Чтобы исправить сломанную ветку при попытке оформления заказа, выполните следующие действия:

$ git checkout -f master
fatal: unable to read tree 5ace24d474a9535ddd5e6a6c6a1ef480aecf2625

Попробуйте удалить его и снова оформить заказ из восходящего потока:

$ git branch -D master
$ git checkout -b master github/master

В случае, если git переведет вас в обособленное состояние, проверьте master и сольем в него отделившуюся ветку.

---

Другая идея состоит в том, чтобы рекурсивно перебазировать существующий мастер:

$ git reset HEAD --hard
$ git rebase -s recursive -X theirs origin/master

---

Смотрите также:

• Несколько приемов восстановления больших двоичных объектов, чтобы исправить поврежденный репозиторий.
• Как исправить сломанный репозиторий?
• Как удалить все неработающие ссылки из репозитория?
• Как исправить поврежденный репозиторий git?(см. ссылки)
• Как исправить поврежденный репозиторий git?(кундрум)
• Ошибка при использовании SourceTree с Git:Ошибка 'Summary' с кодом 128:фатальный:не удается прочитать дерево
• Восстановить Поврежденный репозиторий Git Bare
• Восстановление поврежденного репозитория git
• Как исправить ошибку git:объект поврежден
• Как диагностировать и исправить git fatal:не удается прочитать дерево
• Как справиться с этой ошибкой git
• Как исправить поврежденный репозиторий git?
• Как мне "перезаписать", а не "объединить" ветку с другой веткой в Git?
• Как полностью заменить главную ветку в git из другой ветки?
• Мерзавец:"Поврежденный незакрепленный предмет"
• Сброс Git = фатальный:не удается прочитать дерево

Answer 4

Вот шаги, которые я выполнил для восстановления из поврежденного blob-объекта.

1) Идентифицировать поврежденный большой двоичный объект

git fsck --full
  error: inflate: data stream error (incorrect data check)
  error: sha1 mismatch 241091723c324aed77b2d35f97a05e856b319efd
  error: 241091723c324aed77b2d35f97a05e856b319efd: object corrupt or missing
  ...

Поврежденный сгусток - это 241091723c324aed77b2d35f97a05e856b319efd

2) Переместите поврежденный большой двоичный объект в безопасное место (на всякий случай).

mv .git/objects/24/1091723c324aed77b2d35f97a05e856b319efd ../24/

3) Получить родительский элемент поврежденного большого двоичного объекта

git fsck --full
  Checking object directories: 100% (256/256), done.
  Checking objects: 100% (70321/70321), done.
  broken link from    tree 0716831e1a6c8d3e6b2b541d21c4748cc0ce7180
              to    blob 241091723c324aed77b2d35f97a05e856b319efd

Родительский хэш равен 0716831e1a6c8d3e6b2b541d21c4748cc0ce7180.

4) Получаем имя файла, соответствующее поврежденному большому двоичному объекту

git ls-tree 0716831e1a6c8d3e6b2b541d21c4748cc0ce7180
  ...
  100644 blob 241091723c324aed77b2d35f97a05e856b319efd    dump.tar.gz
  ...

Найдите этот конкретный файл в резервной копии или в вышестоящем репозитории git (в моем случае это dump.tar.gz).Затем скопируйте его куда-нибудь внутри вашего локального репозитория.

5) Добавьте ранее поврежденный файл в базу данных объектов git

git hash-object -w dump.tar.gz

6) Празднуйте!

git gc
  Counting objects: 75197, done.
  Compressing objects: 100% (21805/21805), done.
  Writing objects: 100% (75197/75197), done.
  Total 75197 (delta 52999), reused 69857 (delta 49296)

Answer 5

Git checkout действительно может выбирать отдельные файлы из редакции.Просто дайте ему хэш фиксации и имя файла.Более подробная информация вот.

Я думаю, что самый простой способ безопасно исправить это - вернуться к самой новой незафиксированной резервной копии, а затем выборочно выбирать неповрежденные файлы из более новых коммитов.Удачи вам!

Answer 6

Вот две функции, которые могут помочь, если ваша резервная копия повреждена или у вас также есть несколько частично поврежденных резервных копий (это может произойти, если вы создаете резервные копии поврежденных объектов).

Запустите оба в репозитории, который вы пытаетесь восстановить.

Стандартное предупреждение:используйте только в том случае, если вы действительно в отчаянии и создали резервную копию своего (поврежденного) репозитория.Возможно, это ничего не решит, но, по крайней мере, должно подчеркнуть уровень коррупции.

fsck_rm_corrupted() {
    corrupted='a'
    while [ "$corrupted" ]; do
        corrupted=$(                                  \
        git fsck --full --no-dangling 2>&1 >/dev/null \
            | grep 'stored in'                          \
            | sed -r 's:.*(\.git/.*)\).*:\1:'           \
        )
        echo "$corrupted"
        rm -f "$corrupted"
    done
}

if [ -z "$1" ]  || [ ! -d "$1" ]; then
    echo "'$1' is not a directory. Please provide the directory of the git repo"
    exit 1
fi

pushd "$1" >/dev/null
fsck_rm_corrupted
popd >/dev/null

и

unpack_rm_corrupted() {
    corrupted='a'
    while [ "$corrupted" ]; do
        corrupted=$(                                  \
        git unpack-objects -r < "$1" 2>&1 >/dev/null \
            | grep 'stored in'                          \
            | sed -r 's:.*(\.git/.*)\).*:\1:'           \
        )
        echo "$corrupted"
        rm -f "$corrupted"
    done
}

if [ -z "$1" ]  || [ ! -d "$1" ]; then
    echo "'$1' is not a directory. Please provide the directory of the git repo"
    exit 1
fi

for p in $1/objects/pack/pack-*.pack; do
    echo "$p"
    unpack_rm_corrupted "$p"
done

Answer 7

Я решил эту проблему, добавив некоторые изменения, такие как git add -A и git commit снова.