Как я могу записать ценности NAN как специального цвета с imshow в Matplotlib?

Question

Я пытаюсь использовать imshow в Matplotlib для сюжет данных как тепломапа, но некоторые значения являются назами. Я хотел бы, чтобы нан были оказаны как специальный цвет, не найден в сормере.

пример:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
f = plt.figure()
ax = f.add_subplot(111)
a = np.arange(25).reshape((5,5)).astype(float)
a[3,:] = np.nan
ax.imshow(a, interpolation='nearest')
f.canvas.draw()

Результирующее изображение неожиданно все синие (самый низкий цвет в струйной колонне). Однако, если я сделаю так, как это так:

ax.imshow(a, interpolation='nearest', vmin=0, vmax=24)

- Затем я получаю что-то лучшее, но ценности NAN нарисованы одинаковым цветом, что и VMIN ... Есть ли изящный способ, которым я могу установить нан, чтобы быть нарисованным со специальным цветом (например: серый или прозрачный)?

Answer 1

HRM, кажется, я могу использовать маскируемый массив для этого:

masked_array = np.ma.array (a, mask=np.isnan(a))
cmap = matplotlib.cm.jet
cmap.set_bad('white',1.)
ax.imshow(masked_array, interpolation='nearest', cmap=cmap)

Это должно хватить, хотя я все еще открыт для предложений. :

Answer 2

С новыми версиями MATPLOTLIB не нужно больше использовать маскируемый массив.

Например, давайте генерируем массив, где каждое 7-е значение является NAN:

arr = np.arange(100, dtype=float).reshape(10, 10)
arr[~(arr % 7).astype(bool)] = np.nan

Мы можем изменить текущий сормер и построить массив со следующими строками:

current_cmap = matplotlib.cm.get_cmap()
current_cmap.set_bad(color='red')
plt.imshow(arr)