Список кодов ICD-9 в формате XML, CSV или базы данных [Закрыто

StackOverflow https://stackoverflow.com/questions/3653811

  •  01-10-2019
  •  | 
  •  

Вопрос

Я ищу полный перечень кодов ICD-9 (медицинских кодов) для заболеваний и процедур в формате, который можно импортировать в базу данных и ссылаться на программно. Мой вопрос в основном точно такой же, как Ищете ресурсы для кодов ICD-9, Но первоначальный постер пренебрегал, чтобы упомянуть, где именно он «получил Охот за его полный список».

Google определенно не моим другом здесь, как я провел много часов погугующуюся к проблеме и нашел множество развязных списков типов текста (например, CDC) или веб-сайты, где я могу интегрироваться в полный список, но я не могу найти, куда Список, который заполнил бы эти веб-сайты и может быть проанализирован в базу данных. Я верю в файлы здесь ftp://ftp.cdc.gov/pub/health_statistics/nchs/publications/icd9-cm/2009/ Ищите то, что я ищу, но файлы являются богатым текстовым форматом и содержат много мусора и форматирования, который будет трудно удалить точно.

Я знаю, что это должно быть сделано другими, и я пытаюсь избежать дублирования других народов, но я просто не могу найти список XML / CSV / Excel.

Это было полезно?

Решение 2

После удаления RTF было не слишком сложно, чтобы разбирать файл и превратить его в CSV. Мои полученные анализируемые файлы, содержащие все все коды ICD-9 2009 года для заболеваний и процедур: http://www.jacotay.com/files/disease_and_procedurecodes_parsed.zip.Мой парсер, который я написал здесь: http://www.jacotay.com/files/rtfapp.zip. В основном это два шагов - примите файлы с сайта FTP CDC и удалите из них RTF, затем выберите файлы RTF-файлов и разбираем их в файлы CSV. Код здесь довольно грубый, потому что мне нужно только получить результаты один раз.

Вот код для приложения PARSING в случае, если внешние ссылки снижаются (задний конец к форме, которая позволяет вам выбрать имя файла и щелкнуть кнопки, чтобы сделать его)

Public Class Form1

Private Sub btnBrowse_Click(ByVal sender As System.Object, ByVal e As System.EventArgs) Handles btnBrowse.Click
    Dim p As New OpenFileDialog With {.CheckFileExists = True, .Multiselect = False}
    Dim pResult = p.ShowDialog()
    If pResult = Windows.Forms.DialogResult.Cancel OrElse pResult = Windows.Forms.DialogResult.Abort Then
        Exit Sub
    End If
    txtFileName.Text = p.FileName
End Sub

Private Sub btnGo_Click(ByVal sender As System.Object, ByVal e As System.EventArgs) Handles btnGo.Click
    Dim pFile = New IO.FileInfo(txtFileName.Text)
    Dim FileText = IO.File.ReadAllText(pFile.FullName)
    FileText = RemoveRTF(FileText)
    IO.File.WriteAllText(Replace(pFile.FullName, pFile.Extension, "_fixed" & pFile.Extension), FileText)

End Sub


Function RemoveRTF(ByVal rtfText As String)
    Dim rtBox As System.Windows.Forms.RichTextBox = New System.Windows.Forms.RichTextBox

    '// Get the contents of the RTF file. Note that when it is
    '// stored in the string, it is encoded as UTF-16.
    rtBox.Rtf = rtfText
    Dim plainText = rtBox.Text

    Return plainText
End Function


Private Sub Button1_Click(ByVal sender As System.Object, ByVal e As System.EventArgs) Handles Button1.Click
    Dim pFile = New IO.FileInfo(txtFileName.Text)
    Dim FileText = IO.File.ReadAllText(pFile.FullName)
    Dim DestFileLine As String = ""
    Dim DestFileText As New System.Text.StringBuilder

    'Need to parse at lines with numbers, lines with all caps are thrown away until next number
    FileText = Strings.Replace(FileText, vbCr, "")
    Dim pFileLines = FileText.Split(vbLf)
    Dim CurCode As String = ""
    For Each pLine In pFileLines
        If pLine.Length = 0 Then
            Continue For
        End If
        pLine = pLine.Replace(ChrW(9), " ")
        pLine = pLine.Trim

        Dim NonCodeLine As Boolean = False
        If IsNumeric(pLine.Substring(0, 1)) OrElse (pLine.Length > 3 AndAlso (pLine.Substring(0, 1) = "E" OrElse pLine.Substring(0, 1) = "V") AndAlso IsNumeric(pLine.Substring(1, 1))) Then
            Dim SpacePos As Int32
            SpacePos = InStr(pLine, " ")
            Dim NewCode As String
            NewCode = ""
            If SpacePos >= 3 Then
                NewCode = Strings.Left(pLine, SpacePos - 1)
            End If

            If SpacePos < 3 OrElse Strings.Mid(pLine, SpacePos - 1, 1) = "." OrElse InStr(NewCode, "-") > 0 Then
                NonCodeLine = True
            Else
                If CurCode <> "" Then
                    DestFileLine = Strings.Replace(DestFileLine, ",", "&#44;")
                    DestFileLine = Strings.Replace(DestFileLine, """", "&quot;").Trim
                    DestFileText.AppendLine(CurCode & ",""" & DestFileLine & """")
                    CurCode = ""
                    DestFileLine = ""
                End If

                CurCode = NewCode
                DestFileLine = Strings.Mid(pLine, SpacePos + 1)
            End If
        Else
            NonCodeLine = True
        End If


        If NonCodeLine = True AndAlso CurCode <> "" Then 'If we are not on a code keep going, otherwise check it
            Dim pReg As New System.Text.RegularExpressions.Regex("[a-z]")
            Dim pRegCaps As New System.Text.RegularExpressions.Regex("[A-Z]")
            If pReg.IsMatch(pLine) OrElse pLine.Length <= 5 OrElse pRegCaps.IsMatch(pLine) = False OrElse (Strings.Left(pLine, 3) = "NOS" OrElse Strings.Left(pLine, 2) = "IQ") Then
                DestFileLine &= " " & pLine
            Else 'Is all caps word
                DestFileLine = Strings.Replace(DestFileLine, ",", "&#44;")
                DestFileLine = Strings.Replace(DestFileLine, """", "&quot;").Trim
                DestFileText.AppendLine(CurCode & ",""" & DestFileLine & """")
                CurCode = ""
                DestFileLine = ""
            End If
        End If
    Next

    If CurCode <> "" Then
        DestFileLine = Strings.Replace(DestFileLine, ",", "&#44;")
        DestFileLine = Strings.Replace(DestFileLine, """", "&quot;").Trim
        DestFileText.AppendLine(CurCode & ",""" & DestFileLine & """")
        CurCode = ""
        DestFileLine = ""
    End If

    IO.File.WriteAllText(Replace(pFile.FullName, pFile.Extension, "_parsed" & pFile.Extension), DestFileText.ToString)
End Sub

Конец класса

Другие советы

Центры для сервисов Medicaid & Medicare обеспечивают файлы Excel, которые содержат только коды и диагностику, которые могут быть импортированы непосредственно в некоторые базы данных SQL, преобразование Sans.

Запрошенные файлы Excel, по номеру версии

(Обновление: новая ссылка на основе комментариев ниже)

Центр услуг Medicare (CMS) фактически заряжен в ICD, поэтому я думаю, что версии CDC, которые вы, ребята, ссылаясь на справку, могут быть просто копиями или переработными копиями. Здесь (~ трудно найти) страницу Medicare, которую я думаю, содержит оригинальные необработанные данные («Источник истины»).

http://www.cms.gov/medicare/coding/icd9providerdiagnosticcodes/codes.html.

Похоже на этот пост последняя версия V32. Загрузка ZIP вы загружают, будут содержать 4 износно-текстовых файлов, которые отображают кодовый к-к описанию (один файл для каждой комбинации Diag | Proc Proc и Collect | Он также содержит два файла Excel (один для каждого для Diag_Proc), которые имеют три столбца, поэтому код карты для обе Описания (длинные а также короткая).

Очевидно, что очень старая нить, но я недавно провел эту задачу и написал его здесь со ссылками на исходные данные -

http://colinwhite.net/dropplets/icd.

Я пытался получить как ICD-9, так и ICD-10 в базу данных SQLite.

Кажется, хорошо работал.

Вы можете получить файлы кода Orginal RTF отсюдаhttp://ftp.cdc.gov/pub/health_statistics/nchs/publications/icd9-cm/2009/

Лицензировано под: CC-BY-SA с атрибуция
Не связан с StackOverflow
scroll top