创建从data.frame邻接表

Question

我有2列的data.frame：节点A，节点B在帧中的每个条目在节点A和B

之间的曲线图暗示的边缘

必须有一个很好的一行到本data.frame转换成邻接表。任何提示？

Answer 1

快速脏...

> edges <- data.frame(nodea=c(1,2,4,2,1), nodeb=c(1,2,3,4,5))

> adjlist <- by(edges, edges$nodea, function(x) x$nodeb)

> for (i in as.character(unique(edges$nodea))) {
+   cat(i, ' -> ', adjlist[[i]], '\n')
+ }

1  ->  1 5
2  ->  2 4
4  ->  3

> adjlist
edges$nodea: 1
[1] 1 5
------------------------------------------------------------
edges$nodea: 2
[1] 2 4
------------------------------------------------------------
edges$nodea: 4
[1] 3

Answer 2

由于您标记此的igraph ，怎么样使用内置的功能？

> g <- graph.data.frame( edges )
> adjlist <- get.adjedgelist(g)

唯一需要注意的是顶点零索引，将与0.6的igraph有所改变。

Answer 3

> edges <- data.frame(nodea=c(1,2,4,2,1), nodeb=c(1,2,3,4,5))

> attach(edges)

> tapply(nodeb,nodea,unique)

$`1`
[1] 1 5

$`2`
[1] 2 4

$`4`
[1] 3

Answer 4

如何将你甚至代表R中邻接表？它需要对于该组的相邻节点的可变大小的列表;所以，你必须使用一个列表（）;但随后什么好处是它具有它在R'

我能想到与sapply样功能跛花样但它们的线性扫描为每个节点。但玩了1分钟，这里是：成对列表，其中每对的第二项是邻接表的列表。输出是疯狂比datstructure确实是。

> edgelist=data.frame(A=c(1,1,2,2,2),B=c(1,2,2,3,4))
> library(plyr)
> llply(1:max(edgelist), function(a) list(node=a, adjacents=as.list(edgelist$B[edgelist$A==a])))
[[1]]
[[1]]$node
[1] 1

[[1]]$adjacents
[[1]]$adjacents[[1]]
[1] 1

[[1]]$adjacents[[2]]
[1] 2



[[2]]
[[2]]$node
[1] 2

[[2]]$adjacents
[[2]]$adjacents[[1]]
[1] 2

[[2]]$adjacents[[2]]
[1] 3

[[2]]$adjacents[[3]]
[1] 4



[[3]]
[[3]]$node
[1] 3

[[3]]$adjacents
list()


[[4]]
[[4]]$node
[1] 4

[[4]]$adjacents
list()