Creazione di una lista di adiacenza di un data.frame

Question

Ho una data.frame con 2 colonne: nodo A, Nodo B. Ciascuna voce del telaio implica un bordo in un grafico tra il nodo A e B.

Ci deve essere un bel uno-liner per convertire questo data.frame in una lista di adiacenza. Eventuali suggerimenti?

Answer 1

rapido e sporco ...

> edges <- data.frame(nodea=c(1,2,4,2,1), nodeb=c(1,2,3,4,5))

> adjlist <- by(edges, edges$nodea, function(x) x$nodeb)

> for (i in as.character(unique(edges$nodea))) {
+   cat(i, ' -> ', adjlist[[i]], '\n')
+ }

1  ->  1 5
2  ->  2 4
4  ->  3

> adjlist
edges$nodea: 1
[1] 1 5
------------------------------------------------------------
edges$nodea: 2
[1] 2 4
------------------------------------------------------------
edges$nodea: 4
[1] 3

Answer 2

Dal momento che hai contrassegnato questo IGRAPH , come su utilizzando costruito nel funzionalità?

> g <- graph.data.frame( edges )
> adjlist <- get.adjedgelist(g)

Solo avvertimento è i vertici vengono indicizzati a zero, che saranno cambiando con igraph 0,6.

Answer 3

> edges <- data.frame(nodea=c(1,2,4,2,1), nodeb=c(1,2,3,4,5))

> attach(edges)

> tapply(nodeb,nodea,unique)

$`1`
[1] 1 5

$`2`
[1] 2 4

$`4`
[1] 3

Answer 4

come è possibile anche rappresentare una lista di adiacenza a R? necessita elenchi variabile dimensioni per l'insieme di nodi adiacenti; così allora è necessario utilizzare una lista (); ma allora a che serve avere in R?

che posso pensare di trucchi zoppo con funzioni sapply simile ma hanno una scansione lineare per ogni nodo. ma giocare in giro per 1 minuto, qui è: un elenco di pairlists, in cui il secondo elemento di ogni coppia è la lista di adiacenza. uscita è più folle delle datstructure è in realtà.

> edgelist=data.frame(A=c(1,1,2,2,2),B=c(1,2,2,3,4))
> library(plyr)
> llply(1:max(edgelist), function(a) list(node=a, adjacents=as.list(edgelist$B[edgelist$A==a])))
[[1]]
[[1]]$node
[1] 1

[[1]]$adjacents
[[1]]$adjacents[[1]]
[1] 1

[[1]]$adjacents[[2]]
[1] 2



[[2]]
[[2]]$node
[1] 2

[[2]]$adjacents
[[2]]$adjacents[[1]]
[1] 2

[[2]]$adjacents[[2]]
[1] 3

[[2]]$adjacents[[3]]
[1] 4



[[3]]
[[3]]$node
[1] 3

[[3]]$adjacents
list()


[[4]]
[[4]]$node
[1] 4

[[4]]$adjacents
list()