PBS-Programmierung

Question

einige kurze und wahrscheinlich dumme Fragen über PBS:

1- I einreichen Jobs mit

qsub job_file

ist es möglich, einen (Teil-) Job in einer Job-Datei einreichen?

2- Ich habe das folgende Skript:

qsub job_a
qsub job_b

Für AUFTRAG_B starten, wäre es toll, bevor die Ergebnisse der AUFTRAG_A abgeschlossen zu haben. Ist es möglich, eine Art von Barriere oder eine otehr Abhilfe zu setzen, so AUFTRAG_B nicht gestartet wird, bis AUFTRAG_A fertig?

Danke

Answer 1

Antwort auf die erste Frage:

Normalerweise sind Sie nur erlaubt, Aufträge von dem Host zu unterbreiten, zu denen der PBS-Server läuft, aber es hängt davon ab, wie Ihr PBS System eingerichtet ist.

Antwort auf die zweite Frage:

Sie können die Abhängigkeiten verwenden. Lesen Sie über die Option -W in der qsub Dokumentation. Hier ist ein Beispiel Bash-Skript:

dependency_id=$(qsub job_a)
qsub -W depend=afterok:$dependency_id job_b

AUFTRAG_B wird nach AUFTRAG_A Start erfolgreich abgeschlossen hat.

Answer 2

Ja, es ist möglich, einen Job von einem anderen Job zu übergeben, obwohl es einige Einschränkungen hat.

-Ihr Mütter müssen Client-Befehle (qsub) im Pfad haben

- $ USECP versucht, die Dateien aus dem Knoten zu kopieren, dass der erste Job auf läuft.

-Be vorsichtig einreichenden Stellen von anderen Jobs, da können Sie ganz einfach Absturz pbs_server wenn Ihr Skript Anrufe zu viele QSUBS einreichen.

können Sie haben Arbeitsplätze b - z abhängig von Job 'a' mit folgenden Syntax

qsub foo.sh -W abhängen = afterok: Joba

Job-Arrays könnte auch eine gute Lösung sein.

http://docs.adaptivecomputing.com/ Drehmoment / help.htm # Themen / 2-Arbeitsplätze / multiJobSubmission.htm