программирование PBS

Question

несколько коротких и, возможно, глупых вопросов о PBS:

1- Я отправляю вакансии, используя

qsub job_file

Можно ли отправить (под) задание внутри файла задания?

2- У меня есть следующий скрипт:

qsub job_a
qsub job_b

Для запуска job_b было бы здорово иметь результаты до завершения job_a.Можно ли установить какой-то барьер или какое-то другое обходное решение, чтобы job_b не запускался до тех пор, пока job_a не завершится?

Спасибо

Answer 1

Ответ на первый вопрос:

Обычно вам разрешено отправлять задания только с хоста, на котором работает сервер PBS, но это зависит от того, как настроена ваша система PBS.

Ответ на второй вопрос:

Вы можете использовать зависимости.Прочтите об опции -W в документации qsub.Вот пример bash-скрипта:

dependency_id=$(qsub job_a)
qsub -W depend=afterok:$dependency_id job_b

job_b начнется после успешного завершения job_a.

Answer 2

Да, можно отправить работу с другой работы, но здесь есть некоторые оговорки.

-У ваших мам в пути должны быть клиентские команды (qsub).

-$USECP попытается скопировать файлы с узла, на котором выполняется первое задание.

- Будьте осторожны, отправляя задания из других заданий, потому что вы можете легко привести к сбою pbs_server, если ваш сценарий отправки вызовет слишком много qsub.

Вы можете иметь задания b–z, зависящие от задания «a», со следующим синтаксисом

qsub foo.sh -W depend=afterok:jobA

Массивы заданий также могут быть хорошим решением.

http://docs.adaptivecomputing.com/torque/help.htm#topics/2-jobs/multiJobSubmission.htm